一細胞遺伝子発現動態研究ユニット

当研究室では、１細胞レベルでの網羅的な遺伝子発現動態解析を通じてシステムバイオロジー研究を展開することを目的として研究を行います。最先端の1細胞内１分子遺伝子発現解析技術や、ハイスループット解析技術、MEMS技術、バイオインフォマティクス技術、細胞株ライブラリ技術などを融合することにより、１細胞レベルでの包括的な生命理解と網羅的な生物情報収集のための新しいテクノロジーを開発します。そしてこれらを用いて、１細胞レベルからの分化・発生等の生命過程を解析してその原理を追及すると共に、１細胞内の複雑な分子細胞状態を理解するための新しい概念とモデルを構築することを課題としています。

研究テーマ

• 超高感度細胞内遺伝子発現イメージングのための基盤技術開発
• 高次生物における遺伝子発現計測のための技術整備
• 網羅的遺伝子発現解析のためのハイスループット計測法・大規模細胞培養法の確立
• 分化・発生等の生物過程における１細胞遺伝子発現変化の解析とシステム生物学的解析
• １細胞内遺伝子発現動態を理解するための理論・数理モデルの構築

主要論文

1. *Taniguchi, Y., Choi, P. J., Li, G-W., Chen, H., Babu, M., Hearn, J., Emili, A., Xie, X. S.:
   "Quantifying E. coli Proteome and Transcptome with Single-Molecule Sensitivity in Single Cells."
   Science, 329, 533-538 (2010)
2. *Taniguchi, Y., Nishiyama, M., Ishii, Y., Yanagida, T.:
   "Entropy rectifies the Brownian steps of kinesin."
   Nature Chem. Biol., 1, 342-347 (2005)
3. Xie, X. S., Sims, P. A., Greenleaf, W. J., *Taniguchi, Y., Shiroguchi, K., Kim, S.:
   "Methods and systems for single-molecule RNA expression profiling."
   US patent, 138960 (02.12.2010)