統合ゲノミクス研究グループ

当研究グループは近年顕著な進展が見られるゲノム科学を統合生命医科学研究に活用し、免疫関連疾患発症原因の解明、診断、治療法の開発を加速させることがグループ発足時からの一貫した目標である。こうした課題の達成のために、1）センター中央支援活動、2）センター内外との戦略的共同研究、3）探索研究、の3つに大別される研究活動を並行して進めている。特に、近年の急激な大量並列DNAシーケンシング技術などの進歩やその1細胞解析を含めた新技術との融合により、免疫・アレルギー疾患の予防医療につながる新研究領域の開拓を目指す。

研究分野

分子生物 & 遺伝学 / 免疫学

研究テーマ

• たんぱく質分泌の1細胞分析
• 免疫系プロテオミクスとトランスクリプトミクスの技術開発
• 免疫ゲノミクスデータベースの構築

主要論文

1. Shirasaki Y, Yamagishi M, Shimura N, Hijikata A, Ohara O. Shirasaki Y, Yamagishi M, Shimura N, Hijikata A, Ohara O.:
   "Toward an understanding of immune cell sociology: real-time monitoring of cytokine secretion at the single-cell level."
   IUBMB Life. 65, 28-34 (2012)
2. Kaji T, Ishige A, Hikida M, Taka J, Hijikata A, et al.:
   "Distinct cellular pathways select germline-encoded and somatically mutated antibodies into immunological memory."
   J Exp Med. 209, 2079-2097 (2012)
3. Takezaki S, Yamada M, Kato M, Park MJ et al.:
   "Chronic Mucocutaneous Candidiasis Caused by a Gain-of-Function Mutation in the STAT1 DNA-Binding Domain."
   J Immunol. 189, 1521-1526 (2012)
4. Tofukuji S, Kuwahara M, Suzuki J, Ohara O, Nakayama T, Yamashita M.:
   "Identification of a New Pathway for Th1 Cell Development Induced by Cooperative Stimulation with IL-4 and TGF-β."
   J Immunol. 188, 4846-4857 (2012)
5. Takagi H, Fukaya T, Eizumi K, Sato Y, Sato K, et al.:
   "Plasmacytoid dendritic cells are crucial for the initiation of inflammation and T cell immunity in vivo."
   Immunity. 35, 958-971 (2011)
6. Murata Y, Yasumi T, Shirakawa R, Izawa K, Sakai H, et al.:
   "Rapid diagnosis of FHL3 by flow cytometric detection of intraplatelet Munc13-4 protein."
   Blood. 118, 1225-1230 (2011)
7. Motomura Y, Kitamura H, Hijikata A, Matsunaga Y, Matsumoto K, et al.:
   "The transcription factor E4BP4 regulates the production of IL-10 and IL-13 in CD4(+) T cells."
   Nat Immunol. 12, 450-459 (2011)
8. Ito M, Kitamura H, Kikuguchi C, Hase K, Ohno H, Ohara O.:
   "SP600125 inhibits cap-dependent translation independently of the c-Jun N-terminal kinase pathway."
   Cell Struct Funct. 36, 27-33 (2011)
9. Li X, Isono K, Yamada D, Endo TA, Endoh M, et al.:
   "Mammalian polycomb-like Pcl2/Mtf2 is a novel regulatory component of PRC2 that can differentially modulate polycomb activity both at the Hox gene cluster and at Cdkn2a genes."
   Mol Cell Biol. 31, 351-364 (2011)
10. Masuya H, Makita Y, Kobayashi N, Nishikata K, Yoshida Y, et al.:
    "The RIKEN integrated database of mammals."
    Nucleic Acids Res. 39, D861-870 (2011)