統合生命医科学研究センター
統合細胞システム研究チーム
チームリーダー 岡田 眞里子 (Ph.D.)
実験技術の急速な進歩により、生物の膨大な情報をコンピュータによって計算整理し、生物が生きていくための基本原理を探したり、病気の診断や治療に活かそうという動きが世界的に広まっています。生物や細胞を一遺伝子で説明するのではなく、遺伝子の集合体、さらにはそれらの活動のダイナミクスから理解しようとする研究分野はシステムバイオロジーと呼ばれています。当研究室では、ヒトゲノムのドラフトシーケンスが発表された2000年から細胞のシステムバイオロジー研究を行なっています。特に、私達が注目しているのは、高等生物における細胞内シグナル伝達のシステムです。細胞内のシグナル伝達系は細胞外の情報を核に伝え、細胞の生き残りや運命決定に必要な遺伝子を発現させる、高等生物にとって欠かすことのできない反応系です。当研究室では異なる因子によって細胞の増殖と分化を引き起こす乳がん細胞や免疫B細胞などをモデル細胞としてよく用いています。
研究分野
工学 / 生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / コンピューター科学
研究テーマ
- シグナル転写ネットワークのシステムバイオロジー
- シグナル伝達系の定量化とモデル化
- 細胞運命のモデル化
主要論文
- Oyama M, Nagashima T, Suzuki T, Kozuka-Hata H, Yumoto N, Shiraishi Y, Ikeda K, Kuroki Y, Gotoh N, Ishida T, Inoue S, Kitano H, Okada-Hatakeyama M.:
"Integrated quantitative analysis of the phosphoproteome and transcriptome in tamoxifen-resistant breast cancer."
J Biol Chem. 286(1):818-829(2011)
- Nakakuki T, Birtwistle MR, Saeki Y, Yumoto N, Ide K, Nagashima T, Brusch L, Ogunnaike BA, Okada-Hatakeyama M, Kholodenko BN.:
"Ligand-specific c-Fos expression emerges from the spatiotemporal control of ErbB network dynamics."
Cell. 141(5):884-896 (2010)
- Birtwistle MR, Hatakeyama M, Yumoto N, Ogunnaike BA, Hoek JB, Kholodenko BN.:
"Ligand-dependent responses of the ErbB signaling network: experimental and modeling analyses."
Mol Syst Biol. 3:144. (2007)
- Nagashima T, Shimodaira H, Ide K, Nakakuki T, Tani Y, Takahashi K, Yumoto N, Hatakeyama M.:
"Quantitative transcriptional control of ErbB receptor signaling undergoes graded to biphasic response for cell differentiation."
J Biol Chem. 282(6):4045-4056. (2007)
- Hatakeyama M, Kimura S, Naka T, Kawasaki T, Yumoto N, Ichikawa M, Kim JH, Saito K, Saeki M, Shirouzu M, Yokoyama S, Konagaya A.:
"A computational model on the modulation of mitogen-activated protein kinase (MAPK) and Akt pathways in heregulin-induced ErbB signalling."
Biochem J. 373(Pt 2):451-463 (2003)