植物プロテオミクス研究ユニット

植物は急激な外的環境の変化から逃避することが出来ないため、様々な環境変化に対して自らを速やかに変化させて生き抜く能力を獲得しています。その植物に特徴的な環境適応システムの分子機構の解明は、新しい形質を付与したより優れた植物品種の開発に繋がると期待されています。当ユニットではプロテオミクス技術の開発に取り組むとともに、最新のプロテオミクス技術を駆使して植物独自の細胞内シグナルネットワークの解明を目指します。

研究分野

生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / 農学 / 植物 & 動物学

研究テーマ

• タンパク質の修飾状態を解析する技術の開発
• プロテオーム解析手法を用いた植物免疫シグナリングの研究

主要論文

1. Nakagami, H., Sugiyama, N., Ishihama, Y., and Shirasu K.:
   "Shotguns in the front line: phosphoproteomics in plants"
   Plant Cell Physiol. Jan;53(1):118-24. (2012).
2. Joshi, HJ., Hirsch-Hoffmann, M., Baerenfaller, K., Gruissem, W., Baginsky, S., Schmidt, R., Schulze, WX., Sun, Q., van Wijk, KJ., Egelhofer, V., Wienkoop, S., Weckwerth, W., Bruley, C., Rolland, N., Toyoda, T., Nakagami, H., Jones, AM., Briggs, SP., Castleden, I., Tanz, SK., Millar, AH., and Heazlewood, JL.:
   "MASCP Gator: An Aggregation Portal for the Visualization of Arabidopsis Proteomics Data"
   Plant Physiol. Jan;155(1):259-70. (2011).
3. Nakagami, H., Sugiyama, N., Mochida, K., Daudi, A., Yoshida, Y., Toyoda, T., Tomita, M., Ishihama, Y., and Shirasu, K.:
   "Large-scale comparative phosphoproteomics identifies conserved phosphorylation sites in plants"
   Plant Physiol. Jul;153(3):1161-74. (2010)
4. Sugiyama, N., Nakagami, H., Mochida, K., Daudi, A., Tomita, M., Shirasu, K., and Ishihama, Y.:
   "Large-scale phosphorylation mapping reveals the extent of tyrosine phosphorylation in Arabidopsis"
   Mol Syst Biol. 2008;4:193. (2008)
5. Djamei, A., Pitzschke, A., Nakagami, H., Rajh, I., and Hirt, H.:
   "Trojan horse strategy in Agrobacterium transformation: abusing MAPK defense signaling"
   Science. Oct19;318(5849):453-6. (2007)
6. Nakagami, H., Soukupová, H., Schikora, A., Zárský, V., and Hirt, H.:
   "A Mitogen-activated protein kinase kinase kinase mediates reactive oxygen species homeostasis in Arabidopsis"
   J Biol Chem. Dec15;281(50):38697-704. (2006)
7. Veronese, P., Nakagami, H., Bluhm, B., Abuqamar, S., Chen, X., Salmeron, J., Dietrich, RA., Hirt, H., and Mengiste, T.:
   "The membrane-anchored BOTRYTIS-INDUCED KINASE1 plays distinct roles in Arabidopsis resistance to necrotrophic and biotrophic pathogens"
   Plant Cell. Jan;18(1):257-73. (2006)
8. Nakagami, H., Kiegerl, S., and Hirt, H.:
   "OMTK1, a novel MAPKKK, channels oxidative stress signaling through direct MAPK interaction"
   J Biol Chem. Jun25;279(26):26959-66. (2004)
9. Nakagami, H., Kawamura, K., Sugisaka, K., Sekine, M., and Shinmyo, A.:
   "Phosphorylation of retinoblastoma-related protein by the cyclin D/cyclin-dependent kinase complex is activated at the G1/S-phase transition in tobacco"
   Plant Cell. Aug;14(8):1847-57. (2002)
10. Nakagami, H., Sekine, M., Murakami, H., and Shinmyo, A.:
    "Tobacco retinoblastoma-related protein phosphorylated by a distinct cyclin-dependent kinase complex with Cdc2/cyclin D in vitro"
    Plant J. May;18(3):243-52. (1999)