環境資源科学研究センター
メタボローム情報研究チーム
チームリーダー 有田 正規 (D.Sci.)
当チームではメタボロームの定量データ解析、ネットワーク解析、シミュレーションに必要な基盤ソフトウェアの開発を行っています。また、未知代謝産物にも柔軟に対応できるデータベースを構築しています。開発したソフトウェアは他チームにおいて集積したメタボローム、トランスクリプトームデータに応用し、植物のシステム的理解を実現します。
研究分野
化学 / 生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / 植物 & 動物学 / コンピューター科学
研究テーマ
- 網羅的な代謝データの統計解析と解釈
- 代謝ネットワークの解析およびシミュレーションソフトウェアの開発
- 代謝データベースの構築
主要論文
- Fukushima A, Nishizawa T, Hayakumo M, Hikosaka S, Saito K, Goto E, Kusano M:
"Exploring tomato gene functions based on coexpression modules using graph clustering and differential coexpression approaches"
Plant Physiol. 158(4), 1487-502 (2012)
- Hasegawa Y, Arita M
"Fluctuating noise drives Brownian transport"
J R Soc Interface, 9(77), 3554-63, 2012