環境資源科学研究センター
分子リガンド標的研究チーム
チームリーダー BOONE Charles M. (Ph.D.)
ユニークな生理活性を示す小分子リガンドには、生体内に必ず特異的な標的分子が存在します。標的分子の決定は、分子リガンドの作用機構解明に必須であり、創薬研究の要ともなっています。しかし、分子リガンドと標的分子との相互作用は一様でないため、これまで標的分子の決定はきわめて困難でした。当チームは、分裂酵母全遺伝子ORF発現株ライブラリーや出芽酵母遺伝子破壊株ライブラリーを用いた遺伝学的相互作用の検出法をもとにした新しい相互作用検出技術の開発を行います。これを用いて生理活性を引き出す原因となる標的分子を速やかにかつ正確に決定することを目指します。
研究分野
化学 / 生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / 薬学 & 毒物学 / 植物 & 動物学 / 微生物学
研究テーマ
- 化合物と標的分子の相互作用を遺伝学的解析から明らかにする
- 化合物の細胞内作用機序を明らかにする
主要論文
- Andrusiak, K., Piotrowski, JS., and Boone, C.
"Chemical-genomic profiling: systematic analysis of the cellular targets of bioactive molecules."
Bioorg, Med. Chem. 20: 1952-1960, 2012
- Williams, DE., Dalisay, DS., Patrick, BO., Matainaho T., Andrusiak, K., Deshpande, R., Myers, CL., Piotrowski, JS., Boone, C., Yoshida, M., and Andersen, RJ.
"Padanamides A and B, highly modified linear tetrapeptides produced in culture by a Streptomyces sp. isolated from marine sediment collected in Papua New Guinea."
Org. Lett., 13: 3936-3939, 2011.
- Arita, Y., Nishimura, S., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Usui, T., Boone, C., and Yoshida, M.
"Microarray-based target identification using drug hypersensitive fission yeast expressing ORFeome."
Mol. Biosyst., 7: 1463-1472, 2011.
- Piotrowski, JS., Ho, CH., and Boone, C.
"The awesome power of synergy from chemical-chemical profiling."
Chem. Biol., 17: 789-790, 2010.
- Nishimura, S., Arita, Y., Honda, M., Iwamoto, K., Matsuyama, A., Shirai, A., Kawasaki, H., Kakeya, H., Kobayashi, T., Matsunaga, S., and Yoshida, M.
"Marine antifungal theonellamides target 3beta-hydroxysterol to activate Rho1 signaling."
Nat. Chem. Biol., 6: 519-526, 2010.
- Ho, CH., Magtanong, L., Barker, SL., Gresham, D., Nishimura, S., Natarajan, P., Koh, JL., Porter, J., Gray, CA., Andersen, RJ., Giaever, G., Nislow, C., Andrews, B., Botstein, D., Graham, TR., Yoshida, M., and Boone, C.
"A molecular barcoded yeast ORF library enables mode-of-action analysis of bioactive compounds."
Nat. Biotechnol., 27: 369-377, 2009.