核酸診断技術開発ユニット

特定の病気に対するなりやすさや薬に対する副作用の現れ方を予測したり、感染症における病原体の検出には、生物が持つ遺伝情報物質であるゲノムを調べるDNA検査が一般的です。一方、病気の細胞（例えば癌細胞）と通常の細胞とで遺伝子発現の違いをはっきり区別できるRNA（マーカーとして有用なRNAなど）の情報も、これからの個別化医療に有用です。私たちは、DNAマーカーやRNAマーカーを数分間のうちに、簡便、高信頼性、かつ複雑な測定機器を必要としない試験法で迅速に同定する技術を開発しています。

研究分野

化学 / 生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / 臨床医学 / 微生物学

研究テーマ

• 等温核酸増幅法による遺伝子迅速診断法の開発
• 薬剤耐性判定も可能とする高感度インフルエンザ検出系の構築
• 生体試料からの迅速ゲノム抽出法開発

主要論文

1. *Kimura, Y., Hanami, T., Tanaka, Y., De Hoon, MJ., Soma, T., Harbers, M., Lezhava, A., Hayashizaki, Y., and Usui, K.:
   "Effect of thiazole orage double-labeled thymidine on DNA duplex formation."
   Biochemistry, 51, 6056-6067 (2012).
2. *Kawai, Y., Kimura, Y., Lezhava, A., Kanamori, H., Usui, K., Hanami, T., Soma, T., Morlighem, JÉ., Saga, S., Ishizu, Y., Aoki, S., Endo, R., Oguchi-Katayama, A., Kogo, Y., Mitani, Y., Ishidao, T., Kawakami, C., Kurata, H., Furuya, Y., Saito, T., Okazaki, N., Chikahira, M., Hayashi, E., Tsuruoka, S., Toguchi, T., Saito, Y., Ban, T., Izumi, S., Uryu, H., Kudo, K., Sakai-Tagawa, Y., Kawaoka, Y., Hirai, A., Hayashizaki, Y., and Ishikawa, T. :
   "One-step detection of the 2009 pandemic influenza A(H1N1) virus by the RT-SmartAmp assay and its clinical validation."
   PLoS One, 7, e30236 (2012).
3. *Tanaka, Y., Kimura, Y., Mitani, Y., Kawai, Y., Lezhava, A., Noma, S., Tagami, M., Kawai, J., Hayashizaki, Y., and Usui, K. :
   "Effect of the turn-back primer for intermediate product generation on isothermal DNA amplification."
   BioTechniques, 49, 888-892 (2010).
4. *Xuan, HT., Bertin, N., Ninomiya, N., Fukuda, S., Usui, K., Kawai, J., Hayashizaki, Y., and Suzuki, H. :
   "Development of a high-throughput method for the systematic identification of human proteins nuclear translocation potential."
   BMC Cell Biol., 10: 69, 1-11 (2009).
5. *Ogawa, C., Usui, K., Ito, F., Itoh, M., Hayashizaki, Y., and Suzuki H. :
   "Role of SMN protein components in snRNP assembly."
   J. Biol. Chem., 284, 14609-14617 (2009).
6. *Ito, F., Usui, K., Kawahara, D., Suenaga, A., Maki, T., Kidoaki, S., Suzuki, H., Taiji, M., Itoh, M., Hayashizaki, Y., and T Matsuda. :
   "Reversible Hydrogel Formation Driven by Protein-Peptide-Specific Interaction and Chondrocyte Entrapment."
   Biomaterials, 31, 58-66 (2009).
7. *Tatsumi, K., Mitani, Y., Watanabe, J., Takakura, H., Hoshi, K., Kawai, Y., Kikuchi, T., Kogo, Y., Katayama, A., Tomaru, Y., Kanamori, H., Baba, M., Ishidao, T., Usui, K., Itoh, M., Cizdziel, P., Lezhava, A., Ueda, M., Ichikawa, Y., Endo, I., Shimada, H., and Hayashizaki, Y. :
   "Rapid screening assay for KRAS mutations by the modified smart amplification process."
   J. Mol. Diagn., 10, 520-526 (2008).
8. *Usui, K., Maki, T., Ito, F., Suenaga, A., Kidoaki, S., Itoh, M., Taiji, M., Matsuda, T., Hayashizaki, Y., and Suzuki, H. :
   "Nanoscale elongating control of the self-assembled protein filament with the cysteine-introduced building blocks."
   Protein Science, 18, 960-969 (2009).
9. *Kawai, Y., Kikuchi, T., Mitani, Y., Kogo, Y., Itoh, M., Usui, K., Kanamori, H., Kaiho, A., Takakura, H., Hoshi, K., Cizdziel, P., and Hayashizaki, Y. :
   "Sensitive detection of EGFR mutations using a competitive probe to suppress background in the SMart Amplification process."
   Biologicals, 36, 234-238 (2008).
10. *Watanabe, J., Mitani, Y., Kawai, Y., Kikuchi, T., Kogo, Y., Oguchi-Katayama, A., Kanamori, H., Usui, K., Itoh, M., Cizdziel, P., Lezhava, A., Tatsumi, K., Ichikawa, Y., Togo, S., Shimada, H., Hayashizaki, Y. :
    "Use of a competitive probe in assay design for genotyping of the UGT1A1*28 microsatellite polymorphism by the smart-amplification process."
    Biotechniques, 43, 479-484 (2007).