吉田化学遺伝学研究室

「化学遺伝学」とは古典遺伝学における「変異」を化学物質、特に細胞機能調節物質(バイオプローブ)に置き換え、それによって引き起こされるユニークな表現型を分子のレベルで解明することを目指した新しい分子遺伝学です。バイオプローブを用いた化学遺伝学的アプローチから真核細胞の環境応答、細胞周期制御、分子認識等における新たな知見が次々と得られつつあります。当研究室では、化学遺伝学を基盤にさらに微生物学、化学生物学やプロテオミクスなども駆使してバイオプローブの標的分子の機能解析を行うとともに、特にタンパク質の細胞内局在化機構とその制御、アセチル化、メチル化、ユビキチン化、SUMO化などのタンパク質翻訳後修飾とその相互ネットワークなどに焦点を当てて研究を行っています。究めることの楽しさを味わいながら新しい概念形成を目指した基礎・応用研究を進めていきたいと考えています。

研究テーマ

• アセチル化等タンパク質翻訳後修飾の生体機能に関する研究
• スプライシングやヒストン修飾によるエピジェネティクス制御に関する研究
• 新しい生理活性物質の作用機序に関する研究
• ミトコンドリア遺伝におけるDNA組換えの機能
• 糸状菌の二次代謝と病害防除に関する研究

主要論文

1. Nishimura, S., Arita, Y., Honda, M., Iwamoto, K., Matsuyama, A., Shirai, A., Kawasaki, H., Kakeya, H., Kobayashi, T., Matsunaga, S., and Yoshida, M.:
   "Marine antifungal theonellamides targets 3beta-hydroxysterol to activate Rho1 signaling" Nature Chem. Biol., 6: 519-526 (2010)
2. Schneider-Poetsch, T., Usui, T., Kaida, D., and Yoshida, M.:
   "Garbled messages and corrupted translations."
   Nature Chem. Biol., 6: 189-198 (2010)
3. Sasaki, K., Ito, T., Nishino, N., Khochbin, S., and Yoshida, M.:
   "Real-time imaging of histone H4 hyperacetylation in living cells."
   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 106: 16257-16262 (2009)
4. Shirai, A., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Hashimoto, A., Kawamura, Y., Arai, R., Komatsu, Y., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
   "Global analysis of gel mobility of proteins and its use in target identification."
   J. Biol. Chem., 283: 10745-10752 (2008)
5. Dohi, Y., Ikura, T., Hoshikawa, Y., Katoh, Y., Ota, K., Nakanome, A., Muto, A., Omura, S., Ohta, T., Ito, A., Yoshida, M., Noda, T., and Igarashi, K.:
   "Bach1 inhibits oxidative stress-induced cellular senescence by impeding p53 function on chromatin."
   Nature Struct. Mol. Biol., 15: 1246-1254 (2008)
6. Kaida, D., Motoyoshi, H., Tashiro, E., Nojima, T., Hagiwara, M., Ishigami, K., Watanabe, H., Kitahara, T., Yoshida, T., Nakajima, H., Tani, T., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
   "Spliceostatin A targets SF3b and inhibits both splicing and nuclear retention of pre-mRNA"
   Nature Chem. Biol., 3: 576-583 (2007)
7. Shimazu, T., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
   "Multiple histone deacetylases and the CREB-binding protein regulate pre-mRNA 3'-end processing"
   J. Biol. Chem., 282: 4470-4478 (2007)
8. Matsuyama, A., Arai, R., Yashiroda, Y., Shirai, A., Kamata, A., Sekido, S., Kobayashi, Y., Hashimoto, A., Hamamoto, M., Hiraoka, Y., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
   "ORFeome cloning and global analysis of protein localization in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe"
   Nature Biotechnol., 24: 841-847 (2006)
9. Yoshida, Y., Chiba, T., Tokunaga, F., Kawasaki, H., Iwai, K., Suzuki, T., Ito, Y., Matsuoka, K., Yoshida, M., Tanaka, K., and Tai, T.:
   "E3 ubiquitin ligase that recognizes sugar chains"
   Nature, 418: 438-442 (2002)
10. Matsuyama, A., Shimazu, T., Sumida, Y., Saito, A., Yoshimatsu, Y., Seigneurin-Berny, D., Osada, H., Komatsu, Y., Nishino, N., Khochbin, S., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "In vivo destabilization of dynamic microtubules by HDAC6-mediated deacetylation"
    EMBO J., 21: 6820-6831 (2002)