ゲノム資源解析ユニット

当ユニットは、ロシュ454やイルミナHiSeqシーケンサを利用することによって、DNA 塩基配列決定等の遺伝子解析から、エピジェネティックスを含む遺伝子発現制御解析まで、ゲノムをターゲットにした研究を広範囲に支援しています。また、多種生物の遺伝子セットを保有・管理し、要望に応じて配布します。既存の技術にとらわれることなく研究のニーズに柔軟に対応することにより、研究を効率的にサポートしていきます。 最新のシーケンス技術をより積極的に発生生物学研究に利用するとともに、脊椎動物の発生プログラムの種間比較をはじめとする比較ゲノム解析を推進します。

研究テーマ

• 大規模な遺伝子発現解析をはじめとする分子解析の広範囲な支援
• ゲノム・エピゲノム研究のための新規解析技術の開発
• 配列アノテーションなどのバイオインフォマティクス解析支援
• 脊椎動物の比較ゲノム解析

主要論文

1. Smith J, Kuraku S, …. Flicek P, Bronner M, Warren WC, Clifton SW, Wilson RK, and Li W.:
   "Sequencing of the sea lamprey (Petromyzon marinus) genome provide insights into vertebrate evolution."
   Nature Genetics. doi:10.1038/ng.2568 (2013)
2. Kuraku S.:
   "Impact of asymmetric gene repertoire between cyclostomes and gnathostomes."
   Seminars in Cell and Dev Biol. doi:10.1016/j.semcdb.2012.12.009 (2013)
3. Takechi M, Adachi N, Hirai T, Kuratani S, and Kuraku S.:
   "The Dlx genes as clues to vertebrate genomics and craniofacial evolution"
   Seminars in Cell and Dev Biol. doi:10.1016/j.semcdb.2012.12.010 (2013)
4. Oisi Y, Ota KG, Kuraku S, Fujimoto S, and Kuratani S.:
   "Craniofacial development of hagfishes and the evolution of vertebrates."
   Nature. 493: 175-180 (2012)
5. Matsubara K, Kuraku S, Tarui H, Nishimura O, Nishida C, Agata K, Kumazawa Y, and Matsuda Y.:
   "Intra-genomic GC heterogeneity in sauropsids: evolutionary insights from cDNA mapping and GC3 profiling in snake."
   BMC Genomics. 13: 604 (2012)
6. Freter S, Muta Y, O'Neill P, Vassilev VS, Kuraku S, Ladher RK.:
   "Pax2 modulates proliferation during specification of the otic and epibranchial placodes."
   Dev Dyn. 241: 1716-1728 (2012)