微生物材料開発室

微生物は環境や健康に深く関わっており、ますますその研究の重要性が増してきています。当室はJapan Collection of Microorganism (JCM) として1981年設立以来、学術・研究の基盤となる微生物材料の収集・保存・品質管理・提供事業を推進してきました。2007年からは文部科学省ナショナルバイオリソースプロジェクト「一般微生物」の中核拠点機関として国内外の研究開発の動向を把握しつつ、「環境と健康の研究に資する微生物」に焦点をあてて世界最高水準の微生物リソースを整備して、幅広い分野の研究に貢献することをめざしています。環境や健康の研究に有用な微生物リソースの新規開発・整備をはじめとして、微生物群集の構造と機能や難培養微生物についての研究技術などの先導的な微生物リソース関連技術の開発も進めています。

研究テーマ

• 学術研究基盤用微生物の収集・保存・品質管理・提供
• 環境と健康の研究に資する微生物材料の整備
• 新規微生物材料の分離と分類、開発
• 微生物群集や難培養微生物の解析と資源化

主要論文

1. Takashima, M., Sugita, T., Van, B.H., Nakamura, M., and Ohkuma, M.:
   "Taxonomic richness of yeasts in Japan between subtropical and cool temperate areas. "
   PLoS ONE 7: e50784 (2012)
2. Kitahara, M., Sakamoto, M., Tsuchida, S., Kawasumi, K., Amao, H., Benno, Y., and Ohkuma, M.:
   "Bacteroides stercorirosoris sp. nov. and Bacteroides faecichinchillae sp. nov., isolated from chinchilla (Chinchilla lanigera) faeces."
   Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 62: 1145-1150 (2012)
3. Noda, S., Mantini, C., Meloni, D., Inoue, J., Kitade, O., Viscogliosi, E., and Ohkuma M.:
   "Molecular phylogeny and evolution of Parabasalia with improved taxon sampling and new protein markers of actin and elongation factor-1α."
   PLoS ONE 7: e29938 (2012)
4. Sakamoto, M., and Ohkuma, M.:
   "Identification and classification of the genus Bacteroides by multilocus sequence analysis."
   Microbiology 157: 3388-3397 (2011)
5. Obata, T., Goto, Y., Kunisawa, J., Sato, S., Sakamoto, M., Setoyama, H., Matsuki, T., Nonaka, K., Shibata, N., Gohda, M., Kagiyama, Y., Nochi, T., Yuki, Y., Fukuyama, Y., Mukai, A., Shinzaki, S., Fujihashi, K., Sasakawa, C., Iijima, H., Goto, M., Umesaki, Y., Benno, Y., and Kiyono, H.:
   "Indigenous opportunistic bacteria inhabit mammalian gut-associated lymphoid tissues and share a mucosal antibody-mediated symbiosis."
   Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107: 7419-742 (2010)
6. Sato, T., Hongoh, Y., Noda, S., Hattori, S., Ui, S., and Ohkuma, M.:
   "Candidatus Desulfovibrio trichonymphae, a novel intracellular symbiont of the flagellate Trichonympha agilis in termite gut."
   Environ. Microbiol. 11: 1007-1015 (2009)
7. Ohkuma, M., Noda, S., Hongoh, Y., Nalepa, C.A., and Inoue, T.:
   "Inheritance and diversification of symbiotic hypermastigid flagellates from a common ancestor of termites and the cockroach Cryptocercus."
   Proc. R. Soc. B. 276:239-245. (2009)
8. Hongoh, Y., Sharma, V.K., Prakash, T., Noda, S., Toh, H., Taylor,T.D., Kudo, T., Sakaki, Y., Toyoda, A., Hattori, M., and Ohkuma, M.:
   "Genome of an endosymbiont coupling N2 fixation to cellulolysis within protist cells in termite gut."
   Sicence 322,1108-1109 (2008)
9. Ohkuma, M.:
   "Symbioses of flagellates and prokaryotes in the gut of lower termites."
   Trends Microbiol. 16, 345-352 (2008)
10. Hongoh, Y., Sharma, V.K., Prakash, T., Noda, S., Taylor,T.D., Kudo, T., Sakaki, Y., Toyoda, A., Hattori, M., and Ohkuma, M.:
    "Complete genome of the uncultured Termite Group 1 bacteria in a single host protist cell."
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 5555-5560 (2008)

組織