疾患ゲノム動態解析技術開発チーム

当技術開発チームでは、バイオリソースセンターに収集された生物遺伝資源のgenotype, phenotype, epigenotypeを解析するための新しい技術・リソースの開発を行い、これを基礎として、環境中の様々な要因・ストレスが遺伝子発現・ゲノム修飾、ひいては生物の発生・成長に与える影響や、生体システムが破綻した状態である疾患発症との関連を解析するための技術、モデル系の開発を行う。また世代間を伝達するエピ変異の実態、生物学的意義、疾患発症との関連を解析します。

研究分野

生物学 & 生化学 / 分子生物 & 遺伝学 / 植物 & 動物学 / 学際研究

研究テーマ

• 微量細胞エピゲノムの包括的解析技術の開発
• 種々の生命現象の可視化と画像解析技術の開発
• 変異マウスを用いた胚発生、疾患関連遺伝子の同定と機能解析

主要論文

1. Sugimoto, M., Kondo, M., Hirose, M., Suzuki, M., Mekada, K., Abe, T., Kiyonari, H., Ogura, A., Takagi, N., Artzt, K. and Abe, K.
   "Molecular identification of t^w5: Vps52 promotes pluripotential cell differentiation through cell-cell interactions."
   Cell Reports 2, 1363-1374. (2012)
2. Okamura, D., Maeda, I., Taniguchi, H., Tokitake, Y., Ikeda, M., Ozato, K., Mise, N., Abe, K., Noce, T., Belmonte, J.C.I., Matsui, Y.
   "Cell-cycle gene-specific control of transcription has a critical role in proliferation of primordial germ cells."
   Genes Dev. 26, 2477-2482. (2012)
   
3. Cao, L, Kobayakawa, S., Yoshiki, A., Abe, K.
   "High resolution intravital imaging of subcellular structures of mouse abdominal organs using a microstage device."
   PLoS One e33876. (2012)
   
4. Inoue, K., Kohda, T., Sugimoto, M., Sado, T., Ogonuki, N., Matoba, S., Shiura, H., Ikeda, R., Mochida, K., Fujii, T., Sawai, K., Otte, A.P., Tian, X.C., Yang, X., Ishino, F., Abe, K. and Ogura, A.
   "Impeding Xist expression from the active X chromosome improves mouse somatic cell cloning."
   Science 330, 496-499. (2010)
5. Kasahara, T., Abe, K., Mekada, K., Yoshiki, A., Kato, T.
   "Genetic variation of melatonin productivity in laboratory mice under domestication."
   Proc. Natl. Acad. Sci, USA 107, 6412-6417. (2010)
   
6. Cao, L., Shitara, H., Sugimoto, M., Hayashi, J.=I., Abe, K., Yonekawa, H.
   "New evidence confirms that the mitochondrial bottleneck is generated without reduction of mitochondrial DNA content in early primordial germ cells of mice."
   PLoS Genetics 5, e1000756. (2009)
   
7. Tomida S, Mamiya T, Sakamaki H, Miura M, Aosaki T,Masuda M, Niwa M, Kameyama T, Kobayashi J, Iwaki Y, Imai S, Ishikawa A, Abe K, Yoshimura T, Nabeshima T & Ebihara S.
   "Usp46, encoding a ubiquitin specific peptidase, is a quantitative trait gene regulating mouse immobile behavior in the tail suspension and forced swimming tests."
   Nature Genetics 41, 688-695. (2009)
   
8. Mise, N., Fuchikami, T., Sugimoto, M., Kobayakawa, S., Ike, F., Ogawa, T., Tada, T., Kanaya, S., Noce, T. and Abe, K.
   "Differences and similarities in the developmental status of embryo-derived stem cells and primordial germ cells revealed by global expression profiling."
   Genes cells 13, 863-877. (2008)
   
9. Sugimoto, M. and Abe, K.
   "X chromosome reactivation initiates in nascent primordial germ cells in mice."
   PLoS Genetics 3, e116. (2007)
   
10. Kobayakawa, S., Miike, K., Nakao, M. and Abe, K.
    "Dynamic changes in the epigenomic state and nuclear organization of differentiating mouse embryonic stem cells."
    Genes Cells 12, 447-460. (2007)