中川RNA生物学研究室

古典的なセントラルドグマの考え方によれば、ゲノムDNAに刻まれた遺伝情報を最終的に遂行するのは機能分子であるタンパク質であり、RNAは単なる情報の仲介役であると考えられてきました。ところが、近年になって、タンパク質に翻訳されない「ノンコーディングRNA」が高等真核生物のゲノムから大量に転写されていること、それらが様々なレベルで遺伝子発現を調節する機能分子として働いている事などが明らかにされ、ノンコーディングRNAこそが生物の複雑さや多様性を生み出す原動力になっているのではないかという魅力的な考え方も提唱されています。当研究室では大量に存在するノンコーディングRNAの中でも細胞の核内に蓄積して安定な構造体を形成するというユニークな性質を持つ一群の遺伝子に注目し、その生理的な機能を実験生物学的な手法を用いて解明することを目指しています。

研究テーマ

• 核内mRNA型ノンコーディングRNAの変異マウスの表現型解析
• 核内mRNA型ノンコーディングRNAが形成する複合体の生化学的解析

主要論文

1. Nakagawa S, Naganuma T, Shioi G, Hirose T.:
   "Malat1 is not an essential component of nuclear speckles in mice."
   RNA 18, 1487-1499 (2012)
2. Nakagawa S. and Hirose, T.:
   "Paraspeckle nuclear bodies--useful uselessness?"
   Cell Mol Life Sci 69, 3027-3036 (2012)
3. Nakagawa S, Naganuma T, Shioi G, Hirose T.:
   "Paraspeckles are subpopulation-specific nuclear bodies that are not essential in mice."
   J Cell Biol. 139, 31-39 (2011)
4. Tsuiji H, Yoshimoto R, Hasegawa Y, Furuno M, Yoshida M, Nakagawa S.:
   "Competition between a noncoding exon and introns: Gomafu contains tandem UACUAAC repeats and associates with splicing factor-1."
   Genes Cells 16, 470-490 (2011)
5. Nakagawa S, Prasanth KV.:
   "eXIST with matrix-associated proteins."
   Trends Cell Biol 21, 321-327 (2011)
6. Hasegawa, Y., Brockdorff, N., Kawano, S., Tsutui, K., & Nakagawa, S.:
   "The matrix protein hnRNP U is required for chromosomal localization of Xist RNA."
   Dev Cell 19, 469-476 (2010)
7. Kubo, F. and Nakagawa, S.:
   "c-hairy1 acts as a node downstream of Wnt signaling to maintain retinal stem cell-like progenitor cells in the ciliary marginal zone"
   Development 136, 1823-1833 (2009)
8. Suga, A., Taira, M. and Nakagawa, S.:
   "The mRNA-like noncoding RNA GLIM family transcription factors regulate the subtype-specific morphogenesis of retinal horizontal cells at post-migratory stages.omafu constitutes a novel nuclear domain in a subset of neurons."
   Dev Biol, 330, 318-328. (2009)
9. Sone, M., Hayashi, T., Tarui, H., Agata, K., Takeichi, M., and Nakagawa, S.:
   "The mRNA-like noncoding RNA Gomafu constitutes a novel nuclear domain in a subset of neurons."
   Journal of Cell Science 120, 248-2506 (2007)
10. Sato, Y., Kasai, T., Nakagawa, S., Tanabe, K., Watanabe, T., Kawakami, K., and Takahashi, Y.:
    "Stable integration and conditional expression of electroporated transgenes in chicken embryos."
    Developmental Biology 305, 616-624 (2007)