情報基盤センター
予防医療情報プラットホーム開発ユニット
ユニットリーダー 渡辺 勝弘
ライフサイエンスにおける網羅的測定技術は目覚ましい進展を遂げており、これを用いて臨床に有用な成果を得る研究が様々に行われています。本ユニットでは、安全かつ慎重に行われるべき臨床情報と大量に産出されるオミックスデータの双方を適切に扱う情報システムの開発を行います。次世代シーケンサをはじめとする最先端の測定機器から産出されるデータを対象にこのシステムを適用することで、予防医療・診断技術開発プログラムで行われる新規バイオマーカーの創出やそれを用いた診断法の早期実現につなげます。
研究分野
分子生物 & 遺伝学 / 免疫学 / 薬学 & 毒物学 / 臨床医学 / コンピューター科学
研究テーマ
- 臨床情報と大量に産出されるオミックスデータの双方を適切に扱う情報システムの開発
- 新規バイオマーカー探索の支援
主要論文
- Kawano M, Kawaji H, Grandjean V, Kiani J, Rassoulzadegan M:
"Novel Small Noncoding RNAs in Mouse Spermatozoa, Zygotes and Early Embryos"
PLoS One. 7(9):e44542 (2012).
- Kanamori-Katayama M, Itoh M, Kawaji H, et al.:
"Unamplified cap analysis of gene expression on a single-molecule sequencer. "
Genome Res. 21(7):1150-9 (2011).
- Kawaji H, Hayashizaki Y, and Daub CO.:
"SDRF2GRAPH - a visualization tool of a spreadsheet-based description of experimental processes"
BMC Bioinformatics. 10(1):133 (2009).
- Kawaji H, Severin J, Lizio M, et al.:
"The FANTOM web resource: from mammalian transcriptional landscape to its dynamic regulation"
Genome Biol. 10(4):R40 (2009).
- Kawaji H, Nakamura M, Takahashi Y, et al.:
"Hidden layers of human small RNAs"
BMC Genomics, 9(1):157 (2008).
- Kawaji H, Frith MC, Katayama S, et al.:
"Dynamic usage of transcription start sites within core promoters"
Genome Biol. 7:R118 (2006).