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吉田化学遺伝学研究室
吉田 稔
主任研究員
吉田 稔 (D.Agr.)
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研究室プロフィール

「化学遺伝学」とは古典遺伝学における「変異」を化学物質、特に細胞機能調節物質(バイオプローブ)に置き換え、それによって引き起こされるユニークな表現型を分子のレベルで解明することを目指した新しい分子遺伝学です。バイオプローブを用いた化学遺伝学的アプローチから真核細胞の環境応答、細胞周期制御、分子認識等における新たな知見が次々と得られつつあります。当研究室では、化学遺伝学を基盤にさらに微生物学、化学生物学やプロテオミクスなども駆使してバイオプローブの標的分子の機能解析を行うとともに、特にタンパク質の細胞内局在化機構とその制御、アセチル化、メチル化、ユビキチン化、SUMO化などのタンパク質翻訳後修飾とその相互ネットワークなどに焦点を当てて研究を行っています。究めることの楽しさを味わいながら新しい概念形成を目指した基礎・応用研究を進めていきたいと考えています。

研究テーマ

  1. アセチル化等タンパク質翻訳後修飾の生体機能に関する研究
  2. スプライシングやヒストン修飾によるエピジェネティクス制御に関する研究
  3. 新しい生理活性物質の作用機序に関する研究
  4. ミトコンドリア遺伝におけるDNA組換えの機能
  5. 糸状菌の二次代謝と病害防除に関する研究

関連リンク

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プレスリリース・研究成果

2011年10月13日
未知機能を多く秘めた「投げ縄型イントロンRNA」の検出法を開発
−イントロン由来の環状RNAを直接蛍光検出し、さらなる機能解明に期待−
2009年09月07日
遺伝子の働きを決めるヒストンアセチル化をリアルタイムで観察
- 蛍光プローブ「Histac」を作製、Histac遺伝子導入で生きた細胞の様子を可視化 -
2009年02月24日
酵母ミトコンドリアでは二重らせんをひねらずにDNA組み換えを開始
- 新原理の発見で、試験管内と生体内での仕組みの矛盾を解消 - 新しいウィンドウが開きます。
2007年07月23日
遺伝情報を編集する「スプライシング」を阻害する物質を発見
- 遺伝子の中に存在するイントロン(介在配列)の謎解明に新たな糸口 - 新しいウィンドウが開きます。

RIKEN RESEARCH

2009年11月20日
ヒストンアセチル化をリアルタイムでとらえる
新しい蛍光プローブの開発により、遺伝子の活性を変化させる特異的な染色体修飾をリアルタイムで検出することに成功 新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. Nishimura, S., Arita, Y., Honda, M., Iwamoto, K., Matsuyama, A., Shirai, A., Kawasaki, H., Kakeya, H., Kobayashi, T., Matsunaga, S., and Yoshida, M.:
    "Marine antifungal theonellamides targets 3beta-hydroxysterol to activate Rho1 signaling" Nature Chem. Biol., 6: 519-526, 2010.
  2. Schneider-Poetsch, T., Usui, T., Kaida, D., and Yoshida, M.:
    "Garbled messages and corrupted translations."
    Nature Chem. Biol., 6: 189-198, 2010.
  3. Sasaki, K., Ito, T., Nishino, N., Khochbin, S., and Yoshida, M.:
    "Real-time imaging of histone H4 hyperacetylation in living cells."
    Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 106: 16257-16262, 2009.
  4. Shirai, A., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Hashimoto, A., Kawamura, Y., Arai, R., Komatsu, Y., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "Global analysis of gel mobility of proteins and its use in target identification."
    J. Biol. Chem., 283: 10745-10752, 2008.
  5. Dohi, Y., Ikura, T., Hoshikawa, Y., Katoh, Y., Ota, K., Nakanome, A., Muto, A., Omura, S., Ohta, T., Ito, A., Yoshida, M., Noda, T., and Igarashi, K.:
    "Bach1 inhibits oxidative stress-induced cellular senescence by impeding p53 function on chromatin."
    Nature Struct. Mol. Biol., 15: 1246-1254, 2008
  6. Kaida, D., Motoyoshi, H., Tashiro, E., Nojima, T., Hagiwara, M., Ishigami, K., Watanabe, H., Kitahara, T., Yoshida, T., Nakajima, H., Tani, T., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "Spliceostatin A targets SF3b and inhibits both splicing and nuclear retention of pre-mRNA"
    Nature Chem. Biol., 3: 576-583, 2007.
  7. Shimazu, T., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "Multiple histone deacetylases and the CREB-binding protein regulate pre-mRNA 3'-end processing"
    J. Biol. Chem., 282: 4470-4478, 2007.
  8. Matsuyama, A., Arai, R., Yashiroda, Y., Shirai, A., Kamata, A., Sekido, S., Kobayashi, Y., Hashimoto, A., Hamamoto, M., Hiraoka, Y., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "ORFeome cloning and global analysis of protein localization in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe"
    Nature Biotechnol., 24: 841-847, 2006.
  9. Yoshida, Y., Chiba, T., Tokunaga, F., Kawasaki, H., Iwai, K., Suzuki, T., Ito, Y., Matsuoka, K., Yoshida, M., Tanaka, K., and Tai, T.:
    "E3 ubiquitin ligase that recognizes sugar chains"
    Nature, 418: 438-442, 2002.
  10. Matsuyama, A., Shimazu, T., Sumida, Y., Saito, A., Yoshimatsu, Y., Seigneurin-Berny, D., Osada, H., Komatsu, Y., Nishino, N., Khochbin, S., Horinouchi, S., and Yoshida, M.:
    "In vivo destabilization of dynamic microtubules by HDAC6-mediated deacetylation"
    EMBO J., 21: 6820-6831, 2002.

メンバー

主宰者

吉田 稔
主任研究員

スタッフ研究員

凌 楓
専任研究員
松山 晃久
専任研究員
八代田 陽子
専任研究員
伊藤 昭博
専任研究員
松本 健
専任研究員

ポスドク

Tilman Hans Jorg SCHNEIDER-POETSCH
国際特別研究員
芳本 玲
特別研究員

技術系アシスタント

河村 優美
テクニカルスタッフT
橋本 敦史
テクニカルスタッフU
前田 里子
テクニカルスタッフU
高瀬 恵
テクニカルスタッフU
Elliot Colby BRADSHAW
テクニカルスタッフU