メタボローム機能研究グループ

グループディレクター
斉藤 和季 (Ph.D.)
細胞内の全代謝産物を同定および定量し、ゲノム機能と対応させることがメタボロミクス(メタボローム解析)です。植物界の代謝産物の化学的多様性は非常に大きく、20万種にのぼる化学物質があると言われています。当グループでは、主に高性能質量分析計を用いて網羅的な代謝産物解析の技術開発とハイスループット代謝産物解析を行っています。また、これらの非ターゲット解析データからのデータマイニングと未知遺伝子機能同定をセンター内外の研究チームと共同で行っています。また、植物が生産する多様な化合物群は、植物自身の生存にとって重要であるばかりでなく、我々人間の生存にも欠かせない機能を有します。このような植物のもつ多様な物質生産機能の基本原理をシロイヌナズナなどのモデル植物を用いて解明するとともに、農作物、薬用植物などの有用植物における特異的産物の生産システムをゲノムレベルで解明しています。その結果得られた基礎的な知見を直ちに生物工学的に応用する研究も推進しています。
- 植物メタボロームの質量分析計を用いた精密ハイスループット解析手法の開発
- 代謝産物同定のためのデータベースの構築とメタボロームデータ解析のバイオインフォマティクス
- シロイヌナズナ、イネなどの遺伝子組み換え体ライン、コアコレクションなどの代謝プロファイリング、ストレス応答、細胞分化および代謝機能分化に伴うメタボローム解析
- ポストゲノム手法を用いたシロイヌナズナにおける一次・二次代謝産物生合成に関わる遺伝子の網羅的同定
- 有用植物における、フラボノイド、アルカロイド、含硫黄成分、ビタミン、アミノ酸などの生合成や蓄積に関わる新規遺伝子の同定およびネットワーク解明と有用物質生産への応用
- 2010年03月25日
- 窒素の有効利用のためのイネ独自のしくみを発見
- イネの生産性向上に期待 -
- 2007年09月号
- メタボローム研究で人に役立つ植物を
- 2009年07月24日
- タイミングが肝心
植物の概日時計とミトコンドリアの機能は密接に結びついている
- 2009年05月01日
- 甘い成功
カンゾウが有用な化合物を産生する過程がゲノム解析で明らかに
- 2007年09月28日
- 野菜が大事
食用作物に含まれる健康によい成分を制御する遺伝子を発見
- 2007年07月06日
- 植物フラボノイドの構造を決定する
複数の手法を組み合わせて植物の代謝経路を解明
- H. Seki*, S. Sawai*, K. Ohyama*, M. Mizutani, T. Ohnishi, H. Sudo, E. Odette Fukushima, T. Akashi, T. Aoki, K. Saito, T. Muranaka.(*equal contribution):
" Triterpene functional genomics in licorice for identification of CYP72A154 involved in the biosynthesis of glycyrrhizin"
Plant Cell, 23, 4112-4123 (2011) - M. Kusano, H. Redestig, T. Hirai, A. Oikawa, F. Matsuda, A. Fukushima, A. Masanori, S. Watanabe, M. Yano,
K. Hiwasa-Tanase, H. Ezura, K. Saito,:
" Covering chemical diversity of genetically-modified tomatoes using metabolomics for objective substantial equivalence assessment"
PLoS ONE, 6(2): e16989 (2011) - M. Kusano, M. Tabuchi-Kobayashi, A. Fukushima, K. Funayama, C. Diaz, M. Kobayashi, N. Hayashi, Y. Tsuchiya, H. Takahashi, A. Kamata, T. Yamaya, K. Saito,:
" Metabolomics data reveal a crucial role of cytosolic glutamine synthetase 1;1 in coordinating metabolic balance in rice"
Plant J., 66, 456-466 (2011) - K. Saito, F. Matsuda,:
" Metabolomics for functional genomics, systems biology, and biotechnology"
Annu. Rev. Plant Biol., 61, 463-489 (2010) - F. Matsuda, M. Y. Hirai, E. Sasaki, K. Akiyama, K. Yonekura-Sakakibara, N. J. Provart, T. Sakurai, Y. Shimada, K. Saito,:
" AtMetExpress development: A phytochemical atlas of Arabidopsis thaliana development"
Plant Physiol., 152, 566-578 (2010) - A. Fukushima, M. Kusano, N. Nakamichi, M. Kobayashi, N. Hayashi, H. Sakakibara, T. Mizuno, K. Saito,:
" Impact of clock-associated Arabidopsis pseudo-response regulators in metabolic coordination"
Natl. Acad. Sci. USA, 106, 7251-7256 (2009) - K. Yonekura-Sakakibara, T. Tohge, F. Matsuda, R. Nakabayashi, H. Takayama, R. Niida, A. Watanabe-Takahashi, E. Inoue, K. Saito,:
" Comprehensive flavonol profiling and transcriptome coexpression analysis leading to decoding gene-metabolite correlations in Arabidopsis"
Plant Cell, 20, 2160-2176 (2008) - M. Y. Hirai, K. Sugiyama, Y. Sawada, T. Tohge, T. Obayashi, A. Suzuki, R. Araki, N. Sakurai, H. Suzuki, K. Aoki, H. Goda, O. I. Nishizawa, D. Shibata, K. Saito,:
" Omics-based identification of Arabidopsis Myb transcription factors regulating aliphatic glucosinolate biosynthesis"
Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 104, 6478-6483 (2007) - Y. Okazaki, M. Shimojima, Y. Sawada, K. Toyooka, T. Narisawa, K. Mochida, H. Tanaka, F. Matsuda, A. Hirai,
M. Y. Hirai, H. Ohta, K. Saito,:
" A chloroplastic UDP-Glucose pyrophosphorylase from Arabidopsis is the committed enzyme for the first step of sulfolipid biosynthesis."
Plant Cell, 21, 892-909 (2009) - M. Watanabe, K. Mochida, T. Kato, S. Tabata, N. Yoshimoto, M. Noji, K. Saito,:
" Comparative genomics and reverse genetics analysis reveal indispensable functions of the serine acetyltransferase gene family in Arabidopsis"
Plant Cell, 20, 2484-2496 (2008)
主宰者
- 斉藤 和季
- グループディレクター
メンバー
- 榊原 圭子
- 上級研究員
- 草野 都
- 上級研究員
- 岡咲 洋三
- 研究員
- Jianwei TANG
- 研究員
- 東 泰弘
- 研究員
- 中林 亮
- 特別研究員
- 澤井 学
- 特別研究員
- Zhigang YANG
- 特別研究員
- 森 哲哉
- テクニカルスタッフ
- 高野 耕司
- テクニカルスタッフ