植物の量的な向上に関わる生理機能を持つシロイヌナズナ遺伝子、栽培環境の影響を最小限にして最大限の生産性を発揮できるような新機能の付与に関連するシロイヌナズナ遺伝子の探索を行います。遺伝子破壊変異体や遺伝子導入による過剰発現トランスジェニック植物を用いて逆遺伝学的方法で遺伝子機能を明らかにします。環境変化、刺激に応答して機能する遺伝子、代謝制御に関わる遺伝子等を研究対象とします。さらに新規の生産性向上関連遺伝子の探索にはトランスクリプトーム、メタボローム解析技術を活用します。組織特異的発現、植物ホルモンや環境刺激による誘導などの遺伝子発現調節に関わる制御因子、シグナル伝達因子を解析します。

チームリーダー 篠崎 一雄 (D.Sci.)

(1)	環境ストレス応答に関わる制御因子、シグナル伝達因子の探索と解析
(2)	環境ストレス耐性に関与する遺伝子の機能解析と利用
(3)	逆遺伝学および比較ゲノム解析に基づいた植物の生産性と関わる遺伝子の探索と利用
(4)	コムギ、イネなどの応用作物を用いた環境ストレス耐性作物の作出

(1)	Urano, K., Maruyama, K., Ogata, Y., Morishita, Y., Takeda, M., Sakurai, N., Suzuki, H., Saito, K., Shibata, D., Kobayashi, M., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K.: "Characterization of the ABA-regulated global responses to dehydration in Arabidopsis mu metabolomics." Plant J., in press (2009)
(2)	Myouga, F., Hosoda, C., Umezawa, T., Iizumi, H., Kuromori, T., Motohashi, R., Shono, Y., Nagata, N., Ikeuchi, M., and Shinozaki, K.: "Heterocomplex of Arabidopsis chloroplast-targeted iron superoxide dismutases, FSD2 and FSD3, mediates defense against oxidative stress in chloroplast nucleoids and is essential for chloroplast development." Plant Cell, 20, 3148-3162 (2008)
(3)	Umezawa, T., Sakurai, T., Totoki, Y., Toyoda, A., Seki, M., Ishiwata, A., Akiyama, K., Kurotani, A., Yoshida, T., Mochida, K., Kasuga, M., Todaka, D., Maruyama, K., Nakashima, K., Enju, A., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K. et.al.: "Sequencing and analysis of approximately 40,000 soybean cDNA clones from a full-length enriched cDNA library." DNA Res. 15. 333-346 (2008)
(4)	Kuromori, T., Azumi, Y., Hayakawa, S., Kamiya, A., Imura, Y., Wada, T., and Shinozaki, K.: "Homologous chromosome pairing is completed in crossover defective atzip4 mutant." Biochem. Biophys.Res.Commun., 370, 98-103 (2008)
(5)	Fujita, M., Mizukado, S., Fujita, Y., Ichikawa, T., Nakazawa, M., Seki, M., Matsui, M., Yamaguchi-Shinozaki, and Kazuo Shinozaki, K.: "Identification of stress-tolerance-related transcription-factor genes via mini-scale Full-length cDNA over-eXpressor (FOX) gene hunting system." Biochem. Biophys.Res.Commun. 364, 250-257 (2007)
(6)	Takahashi, F., Yoshida, R., Ichimura, K., Mizoguchi, T., Seo, S., Yonezawa, M., and Maruyama, K., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K.: "Dissecting the jasmonate signaling pathway by a novel MAP kinase cascade, in Arabidopsis, MKK3-MPK6." Plant Cell, 19, 805-818 (2007).
(7)	Shinozaki, K. and Yamaguchi-Shinozaki, K.: "Gene networks involved in drought stress response and tolerance." J. Exp Bot. 58, 221-227 (2007)
(8)	Fujita, M., Fujita, Y., Noutoshi, Y., Takahashi, F., Narusaka, Y., Yamaguchi-Shinzoaki, K., and Shinozaki, K.: "Crosstalk between abiotic and biotic stress responses: a current view from the points of convergence in the stress signaling networks." Curr.Opin. Plant Biol. 9, 436-442 (2006)
(9)	Umezawa, T., Fujita, M., Fujita, Y., Yamaguchi-Shinozaki, K., and Shinozaki, K.: "Enginieering drought tolerance in plants: discovering and tailoring genes to unlock the future." Curr.Opin.Biotech., 17, 113-122 (2006).
(10)	Yoshida, R., Umezawa, T., Mizoguchi, T., Takahashi, S., Takahashi, F., and Shinozaki, K.: "The regulatory domain of SRK2E/OST1/SnRK2.6 interacts with ABI1 and integrates ABA and osmotic stress signals controlling stomatal closure in Arabidopsis." J. Bio. Chem., 281, 5310-5318 (2006)