Zhang独立主幹研究ユニット
タンパク質の複雑な生物学的機能は、同様に緻密な三次元構造によって決定されます。正確に折りたたまれた天然構造は、細胞中におけるタンパク質の適切な機能実現にとって不可欠です。天然構造からの小さな歪みが、タンパク質の機能不全を起こし疾患を生じます。我々の目標は、タンパク質構造の計算科学的研究を経て、その機能を理解し調整することです。我々はタンパク質構造予測の手法を開発し、新型構造、新しい生物学的機能、または効果的な治療薬をもつタンパク質を創造するのに設計原理を応用しています。我々はX線結晶構造位相問題を解決するために新しい制約を探求しています。また、様々な薬物標的の新しい阻害剤を発見するために、スキャフォールドを基にしたドラッグデザインの手法を使用しています。
- タンパク質結晶構造における位相修復の直接的手法
- X線結晶構造における密度修正と位相改良
- タンパク質構造の計算予測
- タンパク質フォールディングとデザイン
- スキャフォールドに基づいたドラッグデザイン
- Zhang, K. Y. J.:
"SQUASH - Combining Constraints for Macromolecular Phase Refinement and Extension."
Acta Cryst., D49, 213-222(1993). - Nieh, Y. P., and Zhang, K. Y. J.:
"A two-dimensional histogram-matching method for protein phase refinement and extension."
Acta Cryst., D55, 1893-1900(1999). - O'Neil, J. W., Johnsen, K.., Kim, D. E., Baker, D., and Zhang, K. Y. J.:
"Single site multations induce 3D domain-swapping in the B1 domain of Protein L from Peptostreptococcus magnus."
Structure, 9. 1017-1027(2001). - Zhang, K. Y. J.:
"Multidimensional histograms for density modification."
Methods in Enzymology, 374, 188-203(2003). - Zhang, K. Y. J., Card, G. L., Suzuki, Y., Artis, D. R., Fong, D., Gillette, S., Hsieh, D., Neiman, J., West, B. L., Zhang, C., Milburn, M. V., Kim, S. H., Schlessinger, J., and Bollag, G.:
"A Glutamine Switch Mechanism for Nucleotide Selectivity by Phosphodiesterases."
Molecular Cell, 15, 279-286(2004). - Card., G. L., Blasdel, L., England, B. P., Zhang, C., Suzuki, Y., Gillette, S., Fong, D., Ibrahim, P. N., Artis, D. R., Bollag, G., Milburn, M. V., Kim, S. H., Schlessinger, J., and Zhang, K. Y. J.:
"A family of phosphodiesterase inhibitors discovered by cocrystallography and scaffold-based drug design."
Nature Biotechnology, 23, 201-207(2005) - Zhang, K. Y. J.:
"Crystal structure of PDE families and the potential for rational drug design."
Chapter 29 in Cyclic Nucleotide Phosphodiesterases in Health and Disease, pp 583-605, Eds. Joseph A. Beavo, Sharron H. Francis and Miles D. Houslay, CRC Press, Boca Raton/London/New York(2006). - Zhang, K. Y. J., Milburn, M. V., and Artis, D. R.:
"Scaffold-based drug discover."
Chapter 6 in Structure-based Drug Discovery, pp 129-153, Eds. Harren Jhoti and Andrew Leach, Springer, Dordrecht/Boston/London(2007). - Tsai, J., Lee, J. T., Wang, W., Zhang, J. Z., Cho, H., Mamo, S., Bremer, R., Gillette, S., Kong, J. Haass, N. K., Sproesser, K., Li, L., Smalley, K. S. M., Fong, D., Zhu, Y. L., Marimuthu, A., Nguyen, H., Lam, B., Liu, J., Cheung, I., Rice, J., Suzuki, Y.:
"Discovery of a Novel Selective Inhibitor of Oncogenic B-Raf Kinase with Potent Anti-Melanoma Activity."
PNAS, 105, 3041-3046(2008) - Artis, D. R., Lin, J. J., Zhang, C., Wang, W. Mehra, U., Perreault, M., Erbe, d., Krupka, H. I., England, B. P., Arnold, J., Plotnikov, A. N., Marimuthu, A., Nguyen, H., Will, S., Signaevsky, M., Kral, J. Cantwell, J., Settachatgull, C., Yan, D. P., Hirth.:
"Scaffold-based discovery of indeglitazar, a PPAR pan-active anti-diabetic agent."
PNAS, 106, 262-267(2009)
主宰者
- Kam ZHANG
- 独立主幹研究員
ポスドク
- Kamlesh Kumar SAHU
- 特別研究員
- Ashutosh KUMAR
- 特別研究員
- 趙 泰鎬
- 特別研究員
- David SIMONCINI
- 特別研究員
- Muhammad MUDDASSAR
- 特別研究員
- Arnout Richard Dominiek VOET
- 特別研究員
学生
- Rojan SHRESTHA
- 国際プログラム・アソシエイト
技術系アシスタント
- Francois Charles Matthieu BERENGER
- テクニカルスタッフT

