研究室の紹介
生命系放射光利用システム開発ユニット
山本 雅貴
ユニットリーダー
山本 雅貴 (Ph.D.)
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研究室プロフィール

タンパク質結晶構造解析は放射光からの高輝度かつ波長可変なX線の利用により、飛躍的な進歩を遂げました。第3世代放射光施設SPring-8においても、挿入光源などから発する超高輝度放射光を利用して構造生物学研究に大きな成果を上げています。当ユニットは、SPring-8の理研構造生物学研究用ビームラインを中心に、微小結晶や超格子結晶からの極限結晶構造解析に向けたビームライン光学系や実験ステーションの装置技術開発や、迅速回折強度データ収集システムの構築を目指した利用技術開発を進めています。これらの要素技術開発の集大成として高難度タンパク質の結晶構造解析を可能とする超高輝度マイクロビームビームライン、理研ターゲットタンパクビームライン(BL32XU)を建設しました。また、放射光ビームラインの特徴を活かした超高分解能構造解析などによりタンパク質の構造機能研究を進めるとともに、3本の理研構造生物学研究用ビームライン(BL26B1&B2, BL45XU)の管理・運転も行っています。

研究テーマ

  1. 放射光ビームライン実験装置の高度化にむけた技術開発
  2. 構造生物学研究にむけた新規手法開拓のための研究開発
  3. X線結晶構造解析による構造生物学研究
  4. 理研構造生物ビームラインの維持管理

関連リンク

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主要論文

  1. Hideaki E. Kato, Feng Zhang, Ofer Yizhar, Charu Ramakrishnan, Tomohiro Nishizawa, Kunio Hirata, Jumpei Ito, Yusuke Aita, Tomoya Tsukazaki, Shigehiko Hayashi, Peter Hegemann, Andrés D. Maturana, Ryuichiro Ishitani, Karl Deisseroth, Osamu Nureki.:
    "Crystal structure of the channelrhodopsin light-gated cation channel"
    Nature 482, 369-374 (2012)
  2. Hirata, K., Ueno, G., Nisawa, N., Kawano, Y, Hikima, T., Shimizu, N., Kumasaka, T., Yumoto, H., Tanaka, T., Takahashi, S., Takeshita, K., Ohashi, H., Goto, S., Kitamura, H., and Yamamoto, M.:
    "New Microbeam Beamline at SPring-8, Targeting at Protein Microcrystallography"
    AIP Conference Proceedings 1234, pp. 893-896 (2010)
  3. Hasegawa, K., Hirata, K., Shimizu, T., Shimizu, N., Hikima, T., Baba, S., Kumasaka, T., and Yamamoto, M.:
    "Development of a shutterless continuous rotation method using an X-ray CMOS detector for protein crystallography"
    J. Appl. Cryst. 42, 1165-1175 (2009).
  4. Okazaki N., Hasegawa K., Ueno G., Murakami H., Kumasaka T., and Yamamoto M.:
    "Mail-in data collection at SPring-8 protein crystallography beamlines"
    J. Synchrotron Rad.15, 288-291 (2008).
  5. Shimizu N., Hirata K., Hasegawa K., Ueno G., and Yamamoto M.:
    "Dose dependence of radiation damage for protein crystals studied at various X-ray energies"
    J. Synchrotron Rad.14, 4-10 (2007).
  6. Muramoto, K., Hirata, K., Shinzawa-Itoh, K., Yoko-o, S., Yamashita, E., Aoyama, H., Tsukihara, T., and Yoshikawa, S.:
    "A histidine residue acting as a controlling site for dioxygen reduction and proton pumping by cytochrome c oxidase"
    PNAS, 17;106(7):2165-9 (2007)
  7. Ueno, G., Kanda, H., Hirose, R., Ida, K., Kumasaka, T., and Yamamoto, M.:
    "RIKEN structural genomics beamlines at the SPring-8; high throughput protein crystallography with automated beamline operation."
    J. Structural and Functional Genomics 7, 15-22 (2006).
  8. Hirata, K., Muraoka, S., Suenaga, K., Kuroda, T., Kato, K., Tanaka, H., Yamamoto, M., Takata, M., Yamada, K., and Kigoshi, H.:
    "Structure basis for antitumor effect of aplyronine A."
    J. Mol. Biol. 356, 945-954 (2006).
  9. Kumasaka, T., Yamamoto, M., Yamashita, E., Moriyama, H., and Ueki, T.:
    "Trichromatic concept optimizes MAD experiments in synchrotron X-ray rystallography."
    STRUCTURE, 10, 1205-1210 (2002).
  10. Samatey, F.A., Imada, K., Nagashima, S., Vonderviszt, F., Kumasaka, T., Yamamoto, M., and Namba, K.:
    "Structure of the bacterial flagellar protofilament and implications for a switch for supercoiling."
    Nature, 410, 331-337 (2001).

メンバー

主宰者

山本 雅貴
ユニットリーダー

スタッフ研究員

上野 剛
専任技師
河野 能顕
専任技師
引間 孝明
研究員
平田 邦生
技師