研究所の紹介
X線構造解析研究チーム
小田 俊郎
チームリーダー
小田 俊郎 (Ph.D.)
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研究室プロフィール

アクチンフィラメントを中心に細胞機能を担う細胞内骨格装置の構造とそのダイナミックスを構造生物学の視点から研究しています。 蛋白質構造の解明にはSPring-8の高輝度ビームラインを用いて、X線繊維回折法、小角散乱法、結晶構造解析法の長所を生かし複合的に進めています。 また、蛋白質の構造ダイナミックスの研究は、SPring8を利用したX線非弾性散乱法、ILLや物性研NSEを使用して中性子非弾性散乱法により実験的に解明する一方、 実験により測定できない時間領域の運動性については計算機実験を用い相補的に進めています。 蛋白質複合体のダイナミックスを通して、アクチンの構造から機能の理解を目指しています。また、X線繊維回折法やX線溶液散乱の解析法の開発も進めています。

研究テーマ

  1. F-アクチンの構造とダイナミックスの研究
  2. F-アクチン形成機構とアクチン核形成因子の研究
  3. アクチン変異体を用いたアクチン機能の研究
  4. X線繊維解析法の技術開発

関連リンク

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RIKEN RESEARCH

2009年06月05日
GからFへ−アクチンフィラメントの詳細な構造を解明
タンパク質の高分解能構造解析から、微小フィラメントが細胞運動の駆動力となるメカニズムについて新たな知見が得られた 新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. T. Ito, A. Narita, T. Hirayama, M. Taki, S. Iyoshi, Y. Yamamoto, Y. Maéda and T. Oda.:
    "Human Spire Interacts with the Barbed End of the Actin Filament."
    J Mol. Biol. 406: 416-426.
  2. S. K. Tewarya, T. Oda, A. Kendall, W. Bian, G. Stubb, S.-M. Wonga and K. Swaminathana.:
    "Structure determination of Hibiscus latent Singapore virus by X-ray fiber diffraction: a non-conserved His122 contributes to coat protein stability."
    J Mol Biol. 406:516-526. (2011)
  3. T. Oda and Y. Maéda.:
    "Multiple Conformations of F-actin."
    Structure. 18:761-767. (2010)
  4. T. Oda, M. Iwasa, T. Aihara, Y. Maeda, A. Narita.:
    "The nature of the globular- to fibrous-actin transition."
    Nature. 457:441-445 (2009)
  5. T. Splettstoesser , F. Noe, T. Oda, JC.Smith.:
    "Nucleotide-dependence of G-actin conformation from multiple molecular dynamics simulations and observation of a putatively polymerization-competent superclosed state."
    Proteins 180, 1188-1195 (2009).

メンバー

主宰者

小田 俊郎
チームリーダー

スタッフ研究員

相原 朋樹
研究員