研究所の紹介
分子シグナリング研究チーム
山下 敦子
チームリーダー
山下 敦子 (D.Agr.)
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研究室プロフィール

視覚・聴覚・触覚・味覚・嗅覚などの「感覚」は、我々が外界にむかって開いている唯一の「窓」です。これらは、環境や異なる個体から受け取ったさまざまな情報を変換、統合、認知、処理するという生物にとって重要な機能です。当研究チームでは、感覚受容の第一段階、すなわち外界からのシグナルを受容しそれを生体内で伝達されるシグナルに変換するまでの過程に焦点をあて、それらに携わるタンパク質の構造を知ることにより、その分子メカニズムを明らかにしたいと考えています。具体的には、感覚受容体やその後のシグナル伝達に関わるタンパク質・受容体の制御に関わるタンパク質などを対象に、SPring-8を利用したX線結晶構造解析による構造解明を核とした研究を行います。また、生化学的・生理学的手法を用いた機能解析も並行して行い、得られた知見を統合して感覚受容のしくみを理解することを目指します。

研究テーマ

  1. 感覚受容体の構造・機能解析
  2. 感覚受容シグナル伝達に関わるタンパク質の構造・機能解析
  3. 感覚受容体制御タンパク質の構造・機能解析
  4. タンパク質結晶化支援法の開発

関連リンク

  1. 放射光科学総合研究センターの研究室紹介ページ新しいウィンドウが開きます。

プレスリリース・研究成果

2011年02月25日
膜タンパク質の性状を簡便かつ迅速に解析できる手法の開発に成功
−膜タンパク質解析の最大のハードル「試料調製条件確立」の有効なツールに−

『理研ニュース』(研究最前線)

2007年07月号
難問「感覚受容体の構造解析」に新戦略で挑む新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. Ashikawa Y, Ihara M, Matsuura N, Fukunaga Y, Kusakabe Y, Yamashita A.:
    GFP-based evaluation system of recombinant expression through the secretory pathway in insect cells and its application to the extracellular domains of class C GPCRs.
    Protein Sci. (2011) 20, 1720-1734
  2. Ihara M, Matsuura N, Yamashita A.:
    High-resolution Native-PAGE for membrane proteins capable of fluorescence detection and hydrodynamic-state evaluation
    Anal. Biochem. (2011) 412, 217-223
  3. Singh SK, Piscitelli CL, Yamashita A, Gouaux E.:
    A competitive inhibitor traps LeuT in an open-to-out conformation
    Science (2008) 322, 1655-1661
  4. Ihara M, Okajima T, Yamashita A, Oda T, Hirata K, Nishiwaki H, Morimoto T, Akamatsu M, Ashikawa Y, Kuroda S, Mega R, Kuramitsu S, Sattelle DB, Matsuda K.:
    Crystal structures of Lymnaea stagnalis AChBP in complex with neonicotinoid insecticides imidacloprid and clothianidin.
    Invert Neurosci. (2008) 8, 71-81
  5. Singh SK, Yamashita A, Gouaux E.:
    Antidepressant binding site in a bacterial homologue of neurotransmitter transporters
    Nature (2007) 448, 952-956
  6. Narita, A., Takeda, S., Yamashita, A. & Maeda, Y.:
    Structural basis of actin filament capping at the barbed end: a cryo-electron microscopy study
    EMBO J. (2006) 25, 5626-5633
  7. Yamashita A, Singh SK, Kawate T, Jin Y, Gouaux E.:
    Crystal structure of a bacterial homologue of Na+/Cl--dependent neurotransmitter transporters
    Nature (2005) 437, 215-223
  8. Kim, K., Yamashita, A., Wear, M. A., Maeda, Y. & Cooper, J. A.:
    Capping Protein Binding to Actin in Yeast: Biochemical Mechanism and Physiological Relevance
    J Cell Biol. (2004) 164, 567-580
  9. Takeda, S., Yamashita, A., Maeda, K. & Maeda, Y.:
    Structure of the core domain of human cardiac troponin in the Ca2+-saturated form
    Nature (2003) 424, 35-41
  10. Yamashita, A., Maeda, K. and Maeda, Y.:
    Crystal structure of CapZ: structural basis for actin filament barbed end capping
    EMBO J. (2003) 22, 1529-1538

メンバー

主宰者

山下 敦子
チームリーダー

スタッフ研究員

伊原 誠
研究員

ポスドク

Nipawan NUEMKET
特別研究員
南後 恵理子
リサーチアソシエイト

技術系アシスタント

松浦 紀子
リサーチアシスタント