研究室の紹介
糖鎖構造生物学研究チーム
山口 芳樹
チームリーダー
山口 芳樹 (D.Pharm.)
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研究室プロフィール

タンパク質に結合している糖鎖の機能を解明するためには、糖鎖を立体構造の観点から捉えることが重要になります。当研究チームは、糖タンパク質や糖鎖関連タンパク質の立体構造を明らかにして、糖鎖のもつ機能に迫ります。有機合成的手法や細胞工学的手法を用いて糖鎖・糖タンパク質を調製し、NMRやX線結晶解析等の物理化学的手法により立体構造解析を行っていきます。さらに、バイオインフォマティクスの技術を用いて糖鎖の立体構造のデータベース構築を行い、その立体構造情報から糖鎖のもつシグナルの解読を目指します。特に、タンパク質・糖鎖の変異による疾患の発症メカニズムを立体構造の観点から明らかにして、診断薬・治療薬のデザインと開発を進めていきます。

研究テーマ

  1. 糖鎖の立体構造解析法を開発する
  2. 糖鎖の分子認識とその機能発現を解明する
  3. 糖鎖立体構造のデータベース構築を行う

関連リンク

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プレスリリース・研究成果

2011年06月24日
真菌類などが持つ3重らせん型βグルカンを認識する仕組みを解明
−生体防御システムにおける3重らせん構造認識の秘密が明らかに−
2010年12月23日
異常糖タンパク質を捕まえるレクチンOS-9の立体構造を解明
−糖鎖を目印とするタンパク質の品質管理の仕組みを解く−

RIKEN RESEARCH

2011年11月11日
侵入者の気配を察知せよ
ガの体に侵入する病原体を検出する受容体の立体構造が明らかにされ、真菌感染症の診断に役立つことが期待される 新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. Subedi, G.P., Satoh, T., Hanashima, S., Ikeda, A., Nakada, H., Sato, R., Mizuno, M., Yuasa, N., Fujita-Yamaguchi, Y., and Yamaguchi, Y.:
    "Overproduction of anti-Tn antibody MLS128 single-chain Fv fragment in Escherichia coli cytoplasm using a novel pCold-PDI vector"
    Protein Expr. Purif. 82, 197-204 (2012)
  2. Matsumoto-Takasaki, A., Hanashima, S., Aoki, A., Yuasa, N., Ogawa, H., Sato, R., Kawakami, H., Mizuno, M., Nakada, H., Yamaguchi, Y., and Fujita-Yamaguchi, Y.:
    "Surface plasmon resonance and NMR analyses of anti Tn-antigen MLS128 monoclonal antibody binding to two or three consecutive Tn-antigen clusters"
    J. Biochem. (2011) [Epub ahead of print]
  3. Re, S., Miyashita, N., Yamaguchi, Y., and Sugita, Y.:
    "Structral diversity and changes in conformational equilibria of biantennary complex-type N-glycans in water revealed by replica-exchange molecular dynamics simulation"
    Biophys. J. 101, L44-6 (2011)
  4. Hanashima, S., Kato, K., and Yamaguchi, Y.:
    "13C-NMR quantification of proton exchange at LewisX hydroxyl groups in water"
    Chem. Comm. 47, 10800-10802 (2011)
  5. Fujita, M., Watanabe, R., Jaensch, N., Romanova-Michaelides, M., Satoh, T., Kato, M., Riezman, H., Yamaguchi, Y., Maeda, Y., and Kinoshita, T.:
    "Sorting of GPI-anchored proteins into ER exit sites by p24 proteins is dependent on remodeled GPI"
    J. Cell Biol. 194, 61-75 (2011)
  6. Kanagawa, M., Satoh, T., Ikeda, A., Adachi, Y., Ohno, N., and Yamaguchi, Y.:
    "Structural insights into recognition of triple-helical β-glucans by an insect fungal receptor"
    J. Biol. Chem. 286, 29158-29165 (2011)
  7. Satoh, T., Chen, Y, Hu, D., Hanashima, S., Yamamoto, K., and Yamaguchi, Y.:
    "Structural basis for oligosaccharide recognition of misfolded glycoproteins by OS-9 in ER-associated degradation"
    Mol. Cell 40, 905-916 (2010)
  8. Kanagawa, M., Satoh, T., Ikeda, A., Nakano, Y., Yagi, H., Kato, K., Kojima-Aikawa, K., and Yamaguchi, Y.:
    "Crystal structures of human secretory proteins ZG16p and ZG16b reveal a Jacalin-related β-prism fold"
    Biochem. Biophys. Res. Commun. 404, 201-205 (2011)
  9. Yamaguchi, Y., and Kato, K.:
    "Dynamics and interactions of glycoconjugates probed by stable-isotope-assisted NMR spectroscopy"
    Methods Enzymol. 478, 305-322 (2010)
  10. Kato, K., Yamaguchi, Y., and Arata, Y.:
    "Stable-isotope-assisted NMR approaches to glycoproteins using immunoglobulin G as a model system"
    Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 56, 346-359 (2010)

メンバー

主宰者

山口 芳樹
チームリーダー

スタッフ研究員

花島 慎弥
基幹研究所研究員
金川 真由美
基幹研究所研究員
長江 雅倫
基幹研究所研究員

学生

Ganesh Prasad SUBEDI
国際プログラム・アソシエイト

技術系アシスタント

加藤 雅樹
テクニカルスタッフT
池田 明美
テクニカルスタッフT
菅 秋次
テクニカルスタッフT

客員研究員・客員技師

林 雄太郎
客員主管研究員

その他

鵜澤 洵
研究支援パートタイマー
田中 典子
研究補助パートタイマー
松本 加奈
派遣職員