研究室の紹介
Home > 研究室の紹介 > 基幹研究所 > ケミカルバイオロジー研究領域 > ケミカルゲノミクス研究グループ
ケミカルゲノミクス研究グループ
吉田 稔
グループディレクター
吉田 稔 (D.Agr.)
メールアドレス 研究成果画像の説明はこちら

研究室プロフィール

化学を武器に生物学に挑む「ケミカルバイオロジー」は、従来の分子遺伝学では困難であった生命機能解析を可能にし、新たな現象とメカニズムの発見に大きく貢献してきました。最近の技術革新により、ケミカルバイオロジー研究はより包括的な「ケミカルゲノミクス」への展開が可能となりました。そこで本研究グループでは、新たに見いだされたユニークな遺伝子、タンパク質、樹立された細胞を用いた独創的なアッセイ系を構築し、化合物ライブラリーと卓越した合成技術を駆使することによって特定の生体分子を標的とする独創的な活性物質(分子リガンド)を取得します。さらにその標的分子の解明と生体機能における役割を明らかにすることにより、生命原理の理解を深め、創薬の基盤を構築することを目指します。

研究テーマ

  1. ユニークな活性評価系の確立と分子リガンドの探索
  2. 新規分子リガンドの設計・合成及び標識プローブの創成
  3. 分子リガンドの標的分子の解明
  4. 分子リガンドの作用機構解明と生命科学への応用

関連リンク

  1. 基幹研究所の研究室紹介ページ新しいウィンドウが開きます。
  2. 研究室オリジナルページ新しいウィンドウが開きます。

プレスリリース・研究成果

2011年07月25日
糖転移酵素「GnT-IX」が脳だけに存在する仕組みを解明
−ヒストンの活性化がGnT-IX遺伝子発現を制御−
2010年06月14日
抗カビ物質の新たな作用メカニズムを発見、抗真菌剤の謎を解く
―「生理活性物質の化学」と「ゲノム解析」の融合研究で新たな創薬の実現へ―

『理研ニュース』(研究最前線)

2008年07月号
ケミカルジェネティクスで生命現象に迫り、創薬を目指す新しいウィンドウが開きます。
 

RIKEN RESEARCH

2010年10月22日
新たな作用メカニズムをもつ抗真菌物質
抗真菌物質を対象とした化合物-ゲノム相互作用解析(ケミカルゲノミクス)によるプロファイリングの結果、真菌の細胞膜には、有望な創薬戦略につながるシグナル伝達活性が存在することが明らかになった。 新しいウィンドウが開きます。
2009年11月20日
ヒストンアセチル化をリアルタイムでとらえる
新しい蛍光プローブの開発により、遺伝子の活性を変化させる特異的な染色体修飾をリアルタイムで検出することに成功 新しいウィンドウが開きます。
2007年05月25日
ゲノム解析は「情報」から「モノ」へ
遺伝子と、その遺伝子がコードするタンパク質の関係について新しい知見が明らかになり、治療薬のターゲット探索に新たな可能性が示された。 新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. Nishimura, S., Arita, Y., Honda, M., Iwamoto, K., Matsuyama, A., Shirai, A., Kawasaki, H., Kakeya, H., Kobayashi, T., Matsunaga, S., and Yoshida, M.:
    "Marine antifungal theonellamides target 3beta-hydroxysterol to activate Rho1 signaling."
    Nat. Chem. Biol., 6: 519-526, 2010.
  2. Maekawa, T., Jin, W., and Ishii, S.:
    "The role of ATF-2 family transcription factors in adipocyte differentiation: antiobesity effects of p38 inhibitors."
    Mol. Cell. Biol., 30: 613-625, 2010.
  3. Megumi Ohkubo, Go Hirai, Mikiko Sodeoka.:
    "Synthesis of the DFGH ring system of Type B Physalins: Highly Oxygenated, Cage-Shaped Molecules"
    Angew. Chem. Int. Ed. 48, 3862-3866, 2009.
  4. Sasaki, K., Ito, T., Nishino, N., Khochbin, S., and Yoshida, M.:
    "Real-time imaging of histone H4 hyperacetylation in living cells."
    Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 106: 16257-16262, 2009.
  5. Ho, C. H., Magtanong, L., Barker, S. L., Gresham, D., Nishimura, S., Natarajan, P., Koh, J. L. Y., Proter, J., Gray, C. A., Andersen, R. J., Giaever, G., Nislow, C., Andrews, B., Botstein, D., Graham, T. R., Yoshida, M., and Boone, C.:
    "A molecular barcoded yeast ORF library enables mode-of-action analysis of bioactive compounds."
    Nature Biotechnol., 27: 369-377, 2009.
  6. Taisuke Watanabe, Kiichiro Totani, Ichiro Matsuo, Jun-ichi Maruyama, Katsuhiko Kitamoto, and Yukishige Ito.:
    "Genetic analysis of glucosidase II β-subunit in trimming of high-mannose-type glycans."
    Glycobiology 19, 834-840, 2009.
  7. Fukuda, I., Ito, A., Uramoto, M., Saitoh, H., Kawasaki, H., Osada, H., and Yoshida, M..:
    "Kerriamycin B inhibits protein SUMOylation."
    J. Antibiotics, 62: 221-224, 2009.
  8. Tatsukawa, H., Fukaya, Y., Frampton, G., Martinez-Fuentes, A., Suzuki, K., Kuo, T.-F., Nagatsuma, K., Shimokado, K., Okuno, M., Wu, J., lismaa, S., Matsuura, T., Tsukamoto, H., Zern, M. A., Graham, R. M., and Kojima, S.:
    "Role of transglutaminase 2 in liver injury via crosslinking and silencing of transcription factor, Sp1."
    Gastroenterology, 136: 1783-1795, 2009.
  9. Fukuda, I., Ito, A., Hirai, G., Nishimura, S., Kawasaki, H., Saitoh, H., Kimura, K., Sodeoka, M., and Yoshida, M.:
    "Ginkgolic acid inhibits protein SUMOylation by blocking formation of the E1-SUMO intermediate."
    Chem. Biol., 16: 133-140, 2009.
  10. Yashiroda, Y., Matsuyama, A., and Yoshida, M.:
    "New insights into chemical biology from ORFeome libraries."
    Curr. Opin. Chem. Biol., 12: 55-59, 2008.

メンバー

主宰者

吉田 稔
グループディレクター

スタッフ研究員

大貫 哲男
益田 晶子
基幹研究所技師

ポスドク

竹本 靖
訪問研究員