生物情報基盤構築チーム

チームヘッド
横田 秀夫 (D.Eng.)
理研オリジナルな情報処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、生命現象の解明に貢献することを目的とします。
特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理研内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献します。
- 生物情報基盤システムの開発
- 生きている細胞の現象を記載したライブセルモデルの構築
- 生物情報データ作成のための計測システムの構築
- 2007年4月号
- コンピュータの中で生きる細胞
- Kazuhiro Fujisaki, Hideo Yokota , Naomichi Furushiro ,Shintaro Komatani, Sumito Ohzawa , Yoshimichi Sato ,Daisuke Matsunaga ,Ryutaro Himeno , Toshiro Higuchi, Akitake Makinouchi.:
"Three-Dimensional Microscopic Elemental Analysis Using an Automated High-Precision Serial Sectioning System"
Microscopy and Microanalysis, volume 17, issue 02, pp. 246-251.2011 - Takashi Ijiri and Hideo Yokota.:
"Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation"
Computer Graphics Forum, 29(2011), 7, 2153-2160. - Maeshima K, Iino H, Hihara S, Funakoshi T, Watanabe A, Nishimura M, Nakatomi R, Yahata K, Imamoto F, Hashikawa T, Yokota H, and Imamoto N.:
"Nuclear Pore Formation, but Not Nuclear Growth, is Governed by Cyclin-dependent Kinases (Cdks) During Interphase in Human Dividing Cells"
Nature Structure & Molecular Biology,17,pp.1065-1071(2010) - S. Yoshizawa, A. Belyaev, and H. Yokota.:
"Fast Gauss Bilateral Filtering"
Computer Graphics Forum The International Journal of Eurographics Association, Vol.29(1), pp. 60-74, 2010. - K. Fujisaki, H.Yokota, H. Nakatsuchi, Y. Yamagata, T. Nishikawa, T. Udagawa and A. Makinouchi.:
"Observation of three-dimensional internal structure of steel materials by means of serial sectioning with ultrasonic elliptical vibration cutting"
Journal of Microscopy,vol.237, 1, pp.89-95, (2010) - Kazuhiro Fujisaki, Hideo Yokota, Naomichi Furushiro, Yutaka Yamagata, Takashi Taniguchi, Ryutaro Himeno, Akitake Makinouchi, Toshiro Higuchi.:
"Development of ultra-fine-grain binderless cBN tool for precision cutting of ferrous materials"
Journal of Materials Processing Technology, vol.209, 15-16, pp.5646-5652, (2009) - Satoko Takemoto, Hideo Yokota, Taketoshi Mishima and Ryutaro Himeno.:
"Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information"
Human-Computer Systems Interaction, Series: Advances in Intelligent and Soft Computing, Vol. 60, pp.171-180, Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2009. - Shin Yoshizawa, Satoko Takemoto, Miwa Takahashi, Makoto Muroi, Sayaka Kazami, Hiromi Miyoshi, and Hideo Yokota.:
"Intracellular Volume Registration"
International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, pp. 1407-1412, November 30-December 2, 2009, Pisa, Italy. - Satoko Takemoto and Hideo Yokota.:
"Algorithm Selection for Intracellular Image Segmentation based on Region Similarity"
International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, pp. 1413-1418, November 30-December 2, 2009, Pisa, Italy. - T. Ijiri, K. Takayama, H. Yokota, and T. Igarashi.:
"ProcDef: Local-to-global Deformation for Skeleton-free Character Animation"
Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association (Proc. of Pacific Graphics), Vol.28(7), pp. 1821-1828, 2009.
主宰者
- 横田 秀夫
- チームヘッド
スタッフ研究員
- 吉澤 信
- 基幹研究所研究員
ポスドク
- 井尻 敬
- 基礎科学特別研究員
- 金内-竹本 智子
- 特別研究員
技術系アシスタント
- 中村 佐紀子
- テクニカルスタッフT
- 辻村 有紀
- テクニカルスタッフT
- 西村 将臣
- テクニカルスタッフT