研究室の紹介
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生物情報基盤構築チーム
横田 秀夫
チームヘッド
横田 秀夫 (D.Eng.)
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研究室プロフィール

理研オリジナルな情報処理技術の開発、多次元の計測技術の開発により、生命現象の解明に貢献することを目的とします。
特に、新規の情報処理技術、画像処理技術の研究開発により、理研内外の研究者に向けた、生命現象を定量化する新規ツールを確立することにより、数理生物学、バイオメディカルシミュレーション、医療診断・治療技術の向上に貢献します。

研究テーマ

  1. 生物情報基盤システムの開発
  2. 生きている細胞の現象を記載したライブセルモデルの構築
  3. 生物情報データ作成のための計測システムの構築

関連リンク

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プレスリリース・研究成果

2012年09月21日
網羅的な遺伝子発現情報を3次元空間に描き出す新手法を開発
―トモグラフィーを応用して、遺伝子発現量を迅速・高精度に3次元で再現―
2011年03月03日
素材内部の元素分布を3次元解析する新システムを確立
-工業材料内の介在物の形態観察や組成解析、破壊予測技術に寄与-
2010年08月16日
細胞周期エンジンの司令で核膜孔複合体の形成が開始
-細胞内で最も精緻な構造体「核膜孔複合体」の形成機構解明への一歩-
2010年06月03日
工業材料や部品、製品などの内部構造を1μmの精度で三次元観察
-市販化を目指した装置で、内部構造の三次元観察に成功-
2009年10月06日
超微粒子バインダレスcBN切削工具を開発、鉄鋼材料の鏡面仕上げを実現
-世界で2番目に硬い材料(cBN)を活用したサブミクロン精度の切削加工技術-
2009年08月17日
鉄鋼材料内部の微細な介在物の形態を3次元解析する技術を確立
-工業材料の欠陥、亀裂、介在物の観察や応力解析シミュレーションに寄与-
2008年08月12日
高輝度放射光を光源にした小動物用高分解能in vivo-CTシステムを開発
-生きたまま小動物の気道末梢部位と冠動脈を世界で初めて3次元動態観察- 新しいウィンドウが開きます。
2008年03月10日
人体力学シミュレーションのための軟組織の非線形物性値データベースを構築
-筋組織や臓器の損傷、骨折による組織の変形の予測に貢献- 新しいウィンドウが開きます。

『理研ニュース』(研究最前線)

2007年4月号
コンピュータの中で生きる細胞新しいウィンドウが開きます。
 

主要論文

  1. Kazuhiro Fujisaki, Hideo Yokota , Naomichi Furushiro ,Shintaro Komatani, Sumito Ohzawa , Yoshimichi Sato ,Daisuke Matsunaga ,Ryutaro Himeno , Toshiro Higuchi, Akitake Makinouchi.:
    "Three-Dimensional Microscopic Elemental Analysis Using an Automated High-Precision Serial Sectioning System"
    Microscopy and Microanalysis, volume 17, issue 02, pp. 246-251.2011
  2. Takashi Ijiri and Hideo Yokota.:
    "Contour-based Interface for Refining Volume Segmentation"
    Computer Graphics Forum, 29(2011), 7, 2153-2160.
  3. Maeshima K, Iino H, Hihara S, Funakoshi T, Watanabe A, Nishimura M, Nakatomi R, Yahata K, Imamoto F, Hashikawa T, Yokota H, and Imamoto N.:
    "Nuclear Pore Formation, but Not Nuclear Growth, is Governed by Cyclin-dependent Kinases (Cdks) During Interphase in Human Dividing Cells"
    Nature Structure & Molecular Biology,17,pp.1065-1071(2010)
  4. S. Yoshizawa, A. Belyaev, and H. Yokota.:
    "Fast Gauss Bilateral Filtering"
    Computer Graphics Forum The International Journal of Eurographics Association, Vol.29(1), pp. 60-74, 2010.
  5. K. Fujisaki, H.Yokota, H. Nakatsuchi, Y. Yamagata, T. Nishikawa, T. Udagawa and A. Makinouchi.:
    "Observation of three-dimensional internal structure of steel materials by means of serial sectioning with ultrasonic elliptical vibration cutting"
    Journal of Microscopy,vol.237, 1, pp.89-95, (2010)
  6. Kazuhiro Fujisaki, Hideo Yokota, Naomichi Furushiro, Yutaka Yamagata, Takashi Taniguchi, Ryutaro Himeno, Akitake Makinouchi, Toshiro Higuchi.:
    "Development of ultra-fine-grain binderless cBN tool for precision cutting of ferrous materials"
    Journal of Materials Processing Technology, vol.209, 15-16, pp.5646-5652, (2009)
  7. Satoko Takemoto, Hideo Yokota, Taketoshi Mishima and Ryutaro Himeno.:
    "Segmentation of Anatomical Structure by Using a Local Classifier Derived from Neighborhood Information"
    Human-Computer Systems Interaction, Series: Advances in Intelligent and Soft Computing, Vol. 60, pp.171-180, Springer-Verlag, Berlin Heidelberg, 2009.
  8. Shin Yoshizawa, Satoko Takemoto, Miwa Takahashi, Makoto Muroi, Sayaka Kazami, Hiromi Miyoshi, and Hideo Yokota.:
    "Intracellular Volume Registration"
    International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, pp. 1407-1412, November 30-December 2, 2009, Pisa, Italy.
  9. Satoko Takemoto and Hideo Yokota.:
    "Algorithm Selection for Intracellular Image Segmentation based on Region Similarity"
    International Conference on Intelligent Systems Design and Applications, pp. 1413-1418, November 30-December 2, 2009, Pisa, Italy.
  10. T. Ijiri, K. Takayama, H. Yokota, and T. Igarashi.:
    "ProcDef: Local-to-global Deformation for Skeleton-free Character Animation"
    Computer Graphics Forum: The International Journal of Eurographics Association (Proc. of Pacific Graphics), Vol.28(7), pp. 1821-1828, 2009.

メンバー

主宰者

横田 秀夫
チームヘッド

スタッフ研究員

吉澤 信
基幹研究所研究員

ポスドク

井尻 敬
基礎科学特別研究員
金内-竹本 智子
特別研究員

技術系アシスタント

中村 佐紀子
テクニカルスタッフT
辻村 有紀
テクニカルスタッフT
西村 将臣
テクニカルスタッフT