モデル植物シロイヌナズナの遺伝子発現地図を完成・公開
- 植物の遺伝子の発現パターンと機能をオンラインで知るAtGenExpressプロジェクト -
PRESS RELEASE HIGHLIGHT
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ホルモンが相互作用して働いている様子を解明(上)と機能未知の遺伝子の機能を推定するシステムClusterCutting(下)検索結果の表示画面 生物のいとなみは、生命の設計図と称される遺伝子のDNA配列や遺伝子の発現の仕組みなどで、複雑に展開し、成長していきます。DNA配列の決定や遺伝子の発現解析技術の向上で、生体内の遺伝子発現の動きを丸ごと知ることも可能となっています。
 2003年にモデル植物シロイヌナズナを材料に、生育段階、器官特異性、ストレス応答、栄養などといった植物の反応を丸ごとデータベース化しようというプロジェクトが立ち上がりました。欧米の研究者と共に発足したAtGenExpressプロジェクトです。理研もその一躍を担い、ホルモン応答に関する膨大な量の実験を行い、そのデータをインターネット上で世界に公開してきました。また、今回そのデータを解析した結果、ホルモン応答に関して新しい知見を得ました。
 公開してきた6億以上の解析ポイントからなる遺伝子発現データは、未加工のままであったため、誰もが使えるというわけではありませんでした。このため世界中でデータベースが構築され、シロイヌナズナの遺伝子発現パターンをオンラインで調べることができるようになりました。
 さらに、理研植物科学研究センターらが、機能の未知の遺伝子の発現の機能を推測するデータベース「ClusterCutting」を構築・公開しました。
 これらのデータベースの完成で、植物遺伝子の機能解明が加速するとともに新しい栽培技術の開発や農薬の開発など大きく前進すると期待できます。
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