2011年10月13日
独立行政法人 理化学研究所
未知機能を多く秘めた「投げ縄型イントロンRNA」の検出法を開発
－イントロン由来の環状ＲＮＡを直接蛍光検出し、さらなる機能解明に期待－
報道発表資料
生物を構成するタンパク質は、生命の設計図であるDNAを基に生み出されています。DNAには、タンパク質に翻訳されるエクソンと、翻訳されないイントロンが存在します。タンパク質合成の過程では、不要なイントロン部分は投げ縄型の構造をとって切り取られていきます。この切り取られた投げ縄型イントロンRNAはこれまでガラクタと思われてきましたが、最近になって、遺伝子の発現を調整する機能を持つなど生物学的に重要な役割が明らかとなってきています。まだまだ多くの機能を秘めている投げ縄型イントロンRNAですが、直接的に検出する方法は皆無でした。なぜなら、その特徴的な環状構造ゆえに、直鎖状のRNAを標的とする一般的なRNA検出法を適用できなかったからです。
基幹研究所伊藤ナノ医工学研究室らの研究グループは、この投げ縄型イントロンRNAを選別して検出する蛍光検出法の開発に成功しました。この検出法は、化学反応に基づいて蛍光を発する蛍光活性化合物を付加したプローブと、化学反応を引き起こす還元剤を付加したプローブで構成しています。これら2本のプローブ（RETFプローブ）は、標的RNAに隣り合って結合したときだけ還元反応を引き起こし、蛍光を発します。投げ縄型イントロンRNAが持つ3方向の分岐部分に結合するよう塩基配列を設計し、モデル遺伝子で試したところ、緑色の蛍光シグナルを観測することに成功しました。検出限界感度は500pM（ピコモーラ）と高く、少量の標的RNAの高感度検出を達成しています。
生物細胞内でも検出が期待できるため、これまでガラクタと言われて見過ごされてきたジャンクRNAの新機能発見に貢献します。
独立行政法人理化学研究所
基幹研究所 伊藤ナノ医工学研究室
専任研究員 阿部 洋（あべ ひろし）
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