多方向かつ段階的に進行する細胞分化における運命決定メカニズムの解明究領域略称:細胞運命制御

組織・研究内容

研究課題名
挿入的クロマチン免疫沈降法を利用したB細胞分化維持機構の解析

藤田 敏次
研究代表者
藤田 敏次
大阪大学・微生物病研究所・助教
研究室HPE-mail
藤井 穂高
連携研究者
藤井 穂高
大阪大学・微生物病研究所・准教授 
研究室HPE-mail

研究内容

 細胞分化における運命決定においては、近年、分化を担う転写因子のエピジェネティックな発現制御が注目されてきている。エピジェネティック制御の分子機構の解明には、当該ゲノム領域のクロマチン構造を出来るだけ保持したまま単離し、生化学的・分子生物学的解析を行うことが有効である。申請者らは、生体内でのクロマチン構造を保存したまま解析対象とするゲノム領域を単離する方法として、挿入的クロマチン免疫沈降法 (insertional chromatin immunoprecipitation: iChIP) 法を開発した。iChIP 法を応用することで、解析対象とするゲノム領域に結合する分子(蛋白質・DNA・RNA)の網羅的同定が可能である。

 本研究課題では、B リンパ球分化のエピジェネティクス制御の分子機構を解析する。具体的には、B リンパ球分化を担う主要分化制御因子であるPax5のエピジェネティックな発現制御機構の解明を目指し、iChIP 法を利用することで、Pax5遺伝子プロモーター領域に存在する分子、特にDNAおよび蛋白質の網羅的同定を行う。さらに、同定した分子については、分子生物学的手法を用いて、その機能を解明する。本研究は、B リンパ球分化のエピジェネティクス制御の分子機構の解明ならびに細胞分化維持の基本原理の解明につながる。さらに、iChIP 法を用いた解析法は、その他のエピジェネティクス制御の分子生物学・生化学的解析にも応用されることが考えられる。

主な論文

* correspondence
研究代表者
藤田 敏次

Fujita T, and Fujii H.
Species-specific 5'-genomic structure and multiple transcription start sites in the chicken Pax5 gene.
Gene. 477: 24-31, 2011.

Fujita T, Ryser S, Piuz I, and Schlegel W.
Up-regulation of P-TEFb by the MEK1-extracellular signal-regulated kinase signaling pathway contributes to stimulated transcription elongation of immediate early genes in neuroendocrine cells.
Mol Cell Biol. 28: 1630-1643, 2008.

Fujita T, Ryser S, Tortola S, Piuz I, and Schlegel W.
Gene-specific recruitment of positive and negative elongation factors during stimulated transcription of the MKP-1 gene in neuroendocrine cells.
Nucleic Acids Res. 35: 1007-1017, 2007.

連携研究者
藤井 穂高

Hoshino A, and *Fujii H.
Insertional chromatin immunoprecipitation: a method for isolating specific genomic regions.
J Biosci Bioeng. 108: 446-449, 2009.

Saint Fleur S, Hoshino A, Kondo K, Egawa T, and *Fujii H.
Regulation of Fas-mediated immune homeostasis by an activation-induced protein, Cyclon.
Blood. 114: 1355-1365, 2009.

Hoshino A, Matsumura S, Kondo K, Hirst JA, and *Fujii H.
Inducible translocation trap: a system to detect translocation of signaling molecules induced by extracellular stimuli.
Mol Cell. 15: 153-159, 2004.

 
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